台北市教育局預計明年2月起將動用「地方教育基金」3千多萬元補助外籍生來台就讀大學，但教育委員會日前審查預算時卻發現教育局竟未編列相關預算，懷疑市府規避議會監督，揚言刪除市長特別費，引來柯市長以「對台北的產業布局有需要的，希望不要有人搞破壞」回應；對此，13日教委會召集人吳世正再批柯「一個市長，搞什麼外交」，認為監督是議員的職權，議案不通過就被柯市長批「搞破壞」，他覺得太離譜。

北市議會13日下午召開臨時大會，吳世正提到，柯市長一句話就把台北市民的教育基金補助給印度、馬來西亞的外籍生，「預算沒編、基金也沒編」，這不僅不符合地方教育基金是給高中職以下學校使用的規定，且這3千多萬元還是要發給外籍生，直說「此門一開，永無善了」。

吳世正還說，委員會在審預算時對市府的提案有意見，市長就說「搞破壞」，但這不就是議員的監督職權嗎？更批柯「真以為自己在當皇帝啊」、「市長的教育不能等耶」，火氣相當大。大會主席吳碧珠則打圓場表示，府會間的關係還是要尊重，但她也希望市長要尊重議會審議的結果，避免行政權侵犯到監督權。

吳事後接受訪問時也提到，他們並不是反對交流，而是市府應用正確方式補助，好比透過例行性的國際交流預算，因此，教委會目前暫擱了與國際交流相關的預算案，希望市府能在動用地方基金一事上走正當程序。

該案源於2017年初柯文哲率市府團隊前往東南亞進行8天市政考察，返國後便指示教育局訂定「南洋北流－台北市ICT南鑽人才匯流計畫」，並在10月宣布2018年2月起實行；該計畫將補助240名印度、馬來西亞學生來台攻讀碩博士並提供實習機會，每學期以40人為限，每人補助金額為4萬3千元（含學雜費及住宿費），總計3084萬元，不過款項卻是以台北市地方教育基金支付，引發議員不滿。