由海軍規畫向美採購的12架P-3C長程反潛巡邏機，在馬英九總統任內，以為配合國軍精粹案為由，2013年7月1日在P-3C反潛機返台前，移編給空軍，據指出，蔡英文總統指示國防部訂定新軍事戰略，國安會重新評估，P-3C反潛機是可執行南海海上偵巡任務，基於海空統合兵力運用的效能，國防部在軍種兵力、武器裝備結構的項目中，規畫在機場駐地以及後勤系統不變之下，P-3C反潛機再次移編回海軍運用。

據瞭解，國安會對於馬政府將P-3C反潛機移編給空軍相當不以為意，不同意只以後勤補保統一，以及海軍沒有機場為由，就把海軍建案編列預算採購的武器裝備移編到空軍，尤其P-3C長程反潛巡邏機是具有多功能任務的平台，也是唯一可在南海執行海上偵巡任務的機種，基於美、日兩國的P-3C反潛機機隊，都是編制在海軍，依海軍特性進行各項反潛與偵巡的任務，對於緊急發生的狀況，都能發揮即時有效能的反潛戰力。

統合運用效能佳　S-2T最好範例

海軍人士指出，海軍一直強調反潛兵力在海軍運用，才能發揮其最大效能，以S-2T反潛機為例，在編制於空軍運用時，在本位主義的心態上，自然是以空軍排定任務為主，過去曾發生雖配合海軍軍艦偵巡任務，但對搜索目標的認定不一，還是發生飛行員不聽指揮，在無線電與艦長發生爭吵的事情，所以S-2T反潛機在空軍的期間，偵獲水下目標的績效並不顯著。

該名人士強調，S-2T反潛機移編海軍後，在反潛訓練作戰與海軍同步後，在軍艦接觸水下有異狀時，透過海軍反潛作戰中心的調度，都能在最短時間內抵達軍艦海域進行搜索，以1994年的漢光演習為例，海軍剛加入的濟陽級（諾克斯級）軍艦，在屏東外海先偵測到水下異狀後，緊急呼叫S-2T反潛機進行搜索，並成功鎖定追縱，在距離台南安平外海12.5浬處偵獲中國R級潛艦，所以反潛兵力由海軍統合運用，才能發揮最好的效能。

知情人士指出，2015年12月12日時任馬英九總統規畫登上太平島立碑，來紀念1946年12月12日海軍登上太平島的歷史意義，為了維護總統的安全，軍方規畫總統專機從台灣到太平島的安全空中航路，專機在台灣防空識別區有戰機的伴飛，以及E-2K空中預警機在識區最南端進行的監控外，主要還是部署在南海的紀德與成功艦所構成的防空網，讓衡山指揮中心隨時可掌握專機的動向，但是考量萬一紀德與成功級軍艦的水下安全，海軍曾考量滯空時間長達12小時，巡航距離達2800海浬的P-3C反潛機，前往南海海域進行海上偵巡，以確保紀德艦和成功艦的安全，但為了要飛行超過東沙島海域進行偵巡太過敏感，最後因美方壓力下，改派內政部長出發後，才沒有讓P-3C反潛機前往南沙太平島。

據指出，國安會認為未來南海區域問題只會多不會少，加上太平島定期的「碧海專案」的海上運補作業，甚至海軍針對外島的「衛疆計畫」，P-3C反潛機都可以配合進行海上的偵巡任務，就兵力派遣運用的效能上，P-3C反潛機返回到海軍的編制是有其必要性；至於機場駐地與後勤維修方面，已在屏東機場完成P-3C反潛機的機棚等相關設施，加上P-3C反潛機所使用的發動機與空軍C-130H運輸機、E-2K預警機相同，空軍本來就有發動機的維修能量，所以未來P-3C反潛機編制運用回海軍，但機場駐地與後勤系統是在空軍不變。

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