中央流行疫情指揮中心30日下午宣布首例英國變種病毒境外移入確診案例，總統府發言人張惇涵表示，為因應疫情最新狀況，基於嚴謹的防疫考量，並落實防疫工作，總統府經與中央流行疫情指揮中心研議後，針對2021年總統府元旦升旗典禮相關規劃，決議取消民眾觀禮以及進入總統府參觀兩項調整。

元旦升旗典禮按照原規劃進行，但僅有政府官員暨受邀賓客現場觀禮，取消民眾進場觀禮。總統府表示，誠摯歡迎國人元旦可透過總統府官網、總統府YouTube頻道、蔡總統臉書、賴副總統臉書，及總統府發言人臉書觀看線上直播，一同以線上方式迎接新年到來。原訂元旦上午9點至下午4點的總統府開放參觀活動，也因應防疫考量而取消。

張惇涵表示，蔡總統預計將在元旦當天上午8時30分於總統府內發表新年談話。總統府誠摯感謝「台灣扶輪人元旦升旗典禮委員會」全心全力投入元旦升旗典禮的籌備主辦工作，因相關活動調整，對於各協辦單位，以及想參加相關活動的民眾所造成的困擾，總統府致上誠摯歉意。

張惇涵說，由於近日全國各地皆有慶祝新年之大型活動，提醒民眾持續依照中央流行疫情指揮中心之指引，並配合各地方政府的活動防疫措施，落實「秋冬防疫專案」相關防疫工作。（元旦起外籍人士禁入境+轉機）