有媒體報導，政府去年底公告屏東縣枋寮鄉與佳冬鄉為漁電共生先行區，但當地養殖戶以飼養石斑、午仔魚等高經濟魚種為主，擔憂影響品質與產量，對於設置太陽光電的意願不高。對此，農委會漁業署回應，寒流來襲，屋頂型太陽光電設施能使水溫穩定，反而能保護屏東的高經濟魚種，而列入漁電共生先行區的地方，不代表非得要做漁電共生，全看養殖戶的意願。

去年，中央陸續盤點漁電共生可利用土地，在避開生態疑慮、法定迴避與緩衝區之後，規劃六縣市先行區共 4800 公頃，嘉義縣與台南市為首發公告區域，第二期為高雄市、屏東縣，第三期則為彰化縣與雲林縣。屏東縣目前被劃為漁電共生先行區的魚塭約667公頃，佔整體14%，以枋寮鄉與佳冬鄉部分地區為主。

針對漁電共生先行區的概念，漁業署養殖漁業組副組長陳文深說明，先行區是為了讓國土多元、加值運用，更重要的是讓人們能夠自由選擇，漁業署在彰雲嘉南高屏等六個縣市的說明會都有向漁民報告，劃入先行區不代表非得做漁電共生，絕不會強迫設置。若漁民有意願從事漁電共生，漁業署都會協助，目前一個案場可補助整體金額1/2，最高以500萬為上限。

「漁電共生可分為地面型與屋頂型，屋頂型對水溫的保溫效果更好，更能保護高經濟魚種，這等同讓魚住在房子裡，宛如夏天有陽傘、冬天有暖床。」陳文深表示，從2017年起，漁業署開始補助養殖戶設置屋頂型光電設施，有各類魚種的試驗，其中也包含草蝦跟石斑，未來會請這些養石斑且已設有光電設施的漁民來分享經驗，讓更多人了解。

陳文深也提到，屏東目前有部分養殖戶已結合太陽光電，有些漁民基於經營策略不想要裝設，這都沒關係，他再次強調漁業署不只是尊重而已，也全看漁民的自發性，想或不想裝設。在漁電共生先行區中，目前嘉義漁民的意願蠻高，這可能跟嘉義日照充足有關，對當地漁民兼地主的人有誘因。