指揮中心原定向德國廠商BioNTech購買500萬劑疫苗，卻因外力介入宣告破局，但根據《路透》報導，BNT一名發言人表示，公司仍計畫向台灣提供疫苗，相關討論還在進行中。

指揮中心12月30日公布，國內預計採購2000萬劑疫苗，當中約500萬劑透過COVAX取得，並洽購1000萬劑AZ疫苗和「另一家」500萬劑。

雖然指揮中心早早發出消息，但後續卻從未證實這500萬劑疫苗究竟是向哪家廠商購買，對此，指揮官陳時中17日接受電台專訪首度回應，500萬劑疫苗是和德國公司BNT洽購，但在簽約走到最後一步時，卻遭對方突然喊卡。

陳時中表示，雙方原本已經在相互檢視新聞稿，他在記者會中也好幾次想回應疫苗購買購買進度，但因為「有人不希望台灣太高興」，才遲遲未公布後續消息。

因德國BNT公司將台灣在內的大中華地區代理權授權給中國的上海復星醫藥，17日有媒體詢問陳時中，疫苗喊卡是否就是因中國復興公司攔截，對此，陳時中回應：「我不敢這樣說，也無法證實，但國際間廠商來往，很少是在最後換約時才停下來，通常國際談判都是耗費時間審視各方面細節，並經過法律專家確認，最後簽字才生效。」

雖然陳時中說購買疫苗受阻，但根據《路透》報導，BNT向台灣提供疫苗的計畫並未終止。BNT的一名發言人17日表示，該公司致力在結束全球疫情的大流行，因此向台灣提供疫苗，是對全球承諾的一部分，目前仍在進行討論。

此外，在德國政府的記者會上也有媒體提到，政府是否知道台灣因中國壓力無法取得疫苗，德國外交部發言人莎薩僅回應：「是的。」但沒有多做說明。（獲聘中評委恐遭重罰200萬）