在推廣漁電共生的過程，農委會水產試驗所面臨許多挑戰，不僅要消除生態疑慮、顧及養殖漁民的工作權，同時案場也要符合農委會的規範，太陽能板建蔽率只能在40%以下、漁獲量則要維持70%以上，技術門檻相當高。不過，水試所從2019年起陸續完成文蛤、虱目魚、吳郭魚、泰國蝦、金目鱸、白蝦等6種試驗，發現多數魚蝦產量不受太陽光電設施影響。

水試所今年預計還會完成石斑、七星鱸的試驗，明年則完成午仔魚與烏魚，希望可累積台灣10大養殖物種的試驗成果，持續推動漁電共生發展。針對目前6種試驗結果，水試所海水繁養殖研究中心主任葉信利指出，除了文蛤產量稍受影響外，其他魚蝦都沒有很大差異，文蛤產量仍符合70%規範，但法規是低標，他們還是希望文蛤產量未來可以超過90%或達到100%。

葉信利也提到，水溫超過32度，對所有養殖生物的成長都不好，台灣夏天的養殖池水溫常超過32度，裝設太陽能板反而有遮陽效果，可以讓水溫穩定，冬天還能擋風保暖。文蛤產量受影響，與文蛤餌料是微細藻類有關，微細藻類需要光合作用，夏天雖成長得好，但冬天成長較緩，整體下來，文蛤產量便無法達到90%以上。

對水試所來說，漁電共生的試驗重點不只是維持漁獲量，也要降低對曬池、整池與收成作業的影響。根據檢測結果顯示，養殖池裝設太陽能板後，若透過新的曬池與整池方法，氧化還原電位、電導度、酸鹼值、溶氧量等水質與土壤參數，跟原本沒有裝設太陽能板的曬池、整池效果無太大差異，至於成本的部分，也沒有增加多少費用，僅作業時間拉長4天左右。

在設計漁電共生的養殖池前，需要先考量日後的捕撈作業。若是浮動式太陽光電設施，需採用固定在堤岸上的形式，便不會影響捕撈；立柱式太陽光電設施目前建議養文蛤，只要柱子之間的距離相隔6公尺以上，捕撈機械就能進行操作；另個方式是將養殖池設計為高低池，當水排放出去，讓魚蝦進入深處，就能捕撈。

漁電共生的發展，並不是一路順遂，經歷很多嘗試與挑戰。對此，葉信利感性說道，水產養殖與綠能原本是八輩子湊不上一塊的產業，因國家能源政策，有機會搭在一塊，這對雙方而言，都是很大的挑戰，但他認為，無論是從養殖或能源的角度來看，漁電共生都是很好的模式，養殖管理技術可以藉此升級，邁向自動化、智慧化發展，發電的利潤也能回饋給養殖業者。