珍愛藻礁公投案第二階段連署獲得民眾支持，已經收集近70萬份公投連署書，13日運往荒野保護協會存放，預計3/18截止日時遞交至中選會。但在3月14日凌晨2點，公投領銜人潘忠政在臉書貼文，驚爆自己的臉書帳戶遭多項限制，他稍早受媒體訪問表示，指出限制是無法開直播與不能買廣告1個月，他猜測應該是被惡意檢舉。

潘忠政表示，14日凌晨看到臉書訊息，點下去才發現原來被臉書限制了，被限制不准直播和不能買廣告30天。但其實潘忠政的臉書被限制早有前例，他說早在1月23日藻礁自由日時，自己的一則貼文就曾被禁止刊登，沒想到這次是整個帳號都被限制。

潘忠政表示，他最近已經很少發文、開直播，也很少在買廣告，最多只有轉貼文章，他不知道臉書審查機制為何，所以也無從得知原因，不過近來他也不太想講話，因為有太多不實謠言在散播與惡意的攻擊，過去雖然會想反駁，但他知道如果去回應的話，反而會遭受更多攻擊。

網友於潘忠政發文底下紛紛留言鼓勵，「我們挺你，是潘老師的後盾！」「這一定是藻礁公投勝利的警示。」甚至有網友質疑，「這是被查水表了吧。」

針對潘忠政臉書遭限制，前桃園市議員王浩宇稍早也在臉書發表看法，他認為潘的臉書遭限制的原因是，曾經轉貼影射他是同志的貼文。他表示雖然貼文短短10分鐘內就被臉書下架，但臉書針對性別歧視有相關的規定，輕則停權一個月、重則永久刪除帳號。他當時選擇原諒沒有提告，也沒有要求潘忠政道歉。結果潘忠政把臉書對此歧視言論的懲處，帶風向說是被國家機器惡意攻擊，他認為是刻意誤導民眾，非常不妥當。（NASA將台灣列為國家）