台鐵太魯閣號發生出軌事故後，甫上任的交通部長王國材承諾，台鐵將於3年內完成國營公司化，交通部也在4日將「國營台鐵股份有限公司設置條例草案」上報行政院審查，實施日期則由行政院訂定。

根據「國營台灣鐵路公司設置條例草案」，交通部將設立國營「台灣鐵路股份有限公司」，以企業化原則發展國營鐵路事業，經營鐵路客貨運輸，並依《鐵路法》21條投資、轉投資等業務，得視需求在國內外設分公司。

草案共24條，內容明定台鐵公司將組成董事會，並選出一名具交通運輸經營管理實務經驗背景的總經理；因配合政策所造成的營運虧損，由政府補貼；鐵路基礎設施建設與更新、購置機車與車輛等，由政府編列預算支應；具自償性重大公共建設，由台鐵公司負擔等。

台鐵目前有1.5萬多名員工，組織改革後的員工福利頗受關注，根據草案，現職人員轉調、退休或資遣條件，從公司成立起6個月內，自願退離者，最高加發7個月薪給總和的慰助金。

已達屆齡退休者，慰助金則會依據提前月數發給，從退休生效日往前逆算，每提前1個月退休、就加發1個月薪給；交通部預計編列14億慰助金支應。若是離任後再任公職，再任機關將按比例收繳慰助金，繳回台鐵。

草案也第12條明訂，原機構現職人員，除具交通事業人員或公務人員任用資格者，得由交通部依照個人意願協助安置轉調其他機關，其餘人員均轉調台鐵公司，並仍具公務人員資格，不得因公司成立予以裁員。

至於條例施行前，具有純勞工身份的員工，若依《勞動基準法》退休，任職退休金將由交通部編列預算支應。據台鐵估計，符合者有282人，所需一次退休金約為5億1000多萬元。

資產方面，台鐵公司由政府獨資經營，該條例施行前的交通部鐵道管理局與所屬機構經營、管理具開發效益的國有財產，除了依法不得私有者外，由政府作價投資台鐵公司，其他屬營業需要不動產、動產和相關設施，台鐵公司無償使用。