國內疫情以雙北為起點在蔓延中南部，也造成多家醫院陸續爆發感染個案，自新北市板橋亞東醫院爆發院內感染後，高雄市鳳山區仁惠醫院也中鏢；數間醫院接連淪陷，《上報》也統整截至20日下午4點，全台各醫院染疫狀況一覽。

5/17　新北亞東11確診1死

亞東醫院上午即透過新聞稿聲明指出，10日急診室收治1名新北居民，為萬華茶藝館群聚事件接觸者，14日確診；院方隨即擴大採檢，另驗出7名同房病患與1名看護確診陽性。

18日，亞東醫院則證實1名確診者死亡，另驗出2名護理師採檢呈陽性；此次院內感染共累積11人確診，1人死亡。

5/18　高雄仁惠2確診

同時，位在高雄的仁惠醫院也爆出院內感染危機，17日出現一名男員工確診陽性，且個案10日發病後，每日均到醫院上班，足跡分布甚廣，院方緊急於18日凌晨完成清零計畫，也隨即擴大採檢相關接觸者，驗出1名護理師呈陽性。

5/19　台大醫院10確診

此外，台大醫院工務室（非醫療單位）員工，18日出現發燒症狀，當天採檢後確認為陽性，院方立即通知全辦公室員工接受採檢，並進行環境採檢及清潔消毒。

亞東醫院19日再驗出3人二採呈陽性，截至目前院內感染狀況，指標個案（案1375）共傳染給7名病患、2名病患家屬、2名看護及2名護理人員，累積共14人確診，其中1人死亡。

而台大醫院19日也證實，目前共36人採檢完畢，其中檢出10人陽性，其餘26人已匡列隔離，目前院內感染情況共10人確診，院方也同時展開全院員工普篩。

除上述院內感染情況外，台北市立聯合醫院松德院區19日也傳出有藥師、看護確診，經院長楊添圍證實「這2人並非院內感染」；其中，藥師為萬華區居民，16日確診後，已採檢20位同科員工，皆陰性。

看護則是剛來幾天，16日因發燒被要求至專責醫院採檢，18日確診，目前看護可能接觸的4、50位醫護人員及患者，已同時進行採檢，正在等待採檢結果。

此外，台北市血液透析中心19日一名洗腎患者確診後，該診所採買快篩，供員工檢測，共檢出4名陽性；目前有11名工作人員、67名患者列為居家隔離，待採檢；台北榮總也證實1名工友確診的消息，個案為無症狀確診者，目前匡列相冠接觸者6人，採檢均屬陰性。

台北醫學大學附設醫院19日也說明院內員工確診情況，表示16日深夜2位病房護理師確診、17日上午病房及手術室2位護理師確診，總計有4位同仁確診，目前研判非院內感染。

而汐止國泰醫院19日1名急診醫師出現乾咳、微發燒等輕微不適，經PCR採檢確為陽性；各地多個醫學單位接連爆出確診消息，下午指揮中心19日也正式宣布全台進入三級防疫警戒。

5/20　和平再+5、鳳榮+1

台北市立聯合醫院和平院區13日有2名住院病患確診，20日再新增2名住院病患、3名員工確診；聯醫和平院區醫務長陳重榮上午出面受訪澄清，經疫調，並未發現院內傳播鏈，因此非院內感染，至於其餘確診者資訊，及相關疫調結果將待指揮中心公布。

亞東醫院則於19日下午進行第3次採檢，院方表示3採員工全為陰性，但仍須繼續觀察，並非沒有再出現確診個案的可能性。

此外，花蓮縣政府20日上午10點30分公布榮總鳳林分院一名護理師，14日北上至亞東醫院陪病，15日出現症狀，18日採檢確診；不過，下午1點30分，縣府緊急澄清，該護理師再度採驗後，確為陰性，18日採檢結果應是偽陽性，但也要求該護理師在台北自主隔離14天，確認無事再返回工作地點。