國內疫情嚴峻，本土個案大爆發，台灣也被帛琉認定為疫情「高風險國家」，對於台帛旅遊泡泡的檢疫規定也不適用；外交部1日表示，華航對此將暫停台帛航班至6月中旬，後續視疫情滾動式調整。

台灣原先因為疫情穩定，與帛琉促成旅遊泡泡，讓民眾可以較寬鬆之檢疫規定入境帛琉；但根據帛琉5月6日發布的入境檢疫規定，「低風險國家」的判定標準為過去28天均未發生本土社區感染案例，台灣因為5月間疫情爆發被認定為「高風險國家」，不再適用台帛旅遊泡泡的入出境檢疫規定；華航公司也因此決定，自5月12日起暫停台帛航班至6月中旬，並將視疫情發展採滾動式調整。

帛琉總統惠恕仁（Surangel Whipps, Jr.）曾於5月18日的記者會中表示，儘管台灣調升疫情警戒，仍然樂觀認為不須終止台帛旅遊泡泡，只要台灣的疫情降至低風險標準，即可再次重新開放。

對於帛琉政府擬安排包機將帛琉在台留學生、轉診病患、駐台官員等接回，於帛琉施打疫苗後再返台的規畫，外交部表示，將在台灣醫療院所仍有收治量能，且符合防疫規定的前提下，協助帛琉具有緊急需求的新重症病患轉診來台治療。

至於帛琉目前在台留學生、已在台灣的轉診病患、駐館職雇員等人士擬搭機返國施打疫苗再入境來台一事，則應依台帛2國的入出境及相關檢疫規定辦理，外交部將依據指揮中心的決定，配合辦理。