經濟部長王美花秘書驚傳確診，包括王美花、經濟部次長曾文生檢測結果均為陰性，仍得進行14天居家隔離；然而，王被質疑在隔離期間還赴行政院開院會，恐有觸法之虞。中央流行疫情指揮中心指揮官陳時中5日澄清，隔離時間皆從最後接觸日開始計算，「（王美花）當然沒有違反隔離條件。」

王美花居家隔離時間自6月2日算起14天，但她6月3日依舊出席行政院會，甚至一同出席紓困4.0記者會，引發質疑。台北市衛生局昨說明，該位秘書4日確診，3日親密接觸者才會被匡列，中央進行疫調推測2日為最後接觸時間，因此才從當日推算隔離起算日。

陳時中今則指出，王美花PCR採檢陰性，在前端部分對社會沒有風險性，但後端有無染疫可能很難說，所以要持續隔離；隔離一般都是看跟確診者有無密切接觸，從最後接觸日起算，「那她前端活動當然沒有違反隔離條件。」只不過，王美花丈夫也得自主健康監測。

指揮中心發言人莊人祥進一步說明，該位經濟部秘書在6月4日通報陽性確診，王美花最後一天與秘書接觸是6月2日，所以最後接觸日就是2日，「（王美花）沒有晚一天隔離的問題。」

另方面，金管會被踢爆部內有6位成員近期列入疫苗施打優先名單，新北市衛生局解釋是「中央提過來的」，引發特權質疑。莊人祥澄清，目前疫苗施打本來就涵蓋第二類，也就是中央與地方防疫人員，金管會本來就有部分官員被列入中央防疫人員，接種疫苗沒有問題。

指揮中心疫情監測組組長周志浩也說，指揮中心是跨部會團隊，很多項目各部會相關同仁一起加入運作，或許外界認為他們非衛生單位人員，但防疫工作其實由大家共同完成。