衛福部長陳時中16日證實國內污水監測系統偵測到新冠病毒。指揮中心發言人莊人祥16日對此表示，目前發現兩處污水檢測的Ct值為33至37，雖然證實這些病毒不具有傳染性，但顯示出蒐集到污水的區域，可能曾經或是現在有確診者，因此要設立採檢站，及早把無症狀者找出來。

莊人祥表示，2020年1月發生新冠肺炎疫情以來，全國北中南東共設立11個監測處，就開始監測污水，一直以來都是陰性，一直到6月初，採檢的11個檢體中發現北區的2處陽性，未來會持續監測，因為污水監測是反應社區感染的狀況。

莊人祥表示，污水的監測是為了解是否有病毒活動，過去主要是小兒麻痺根除計畫中，針對全台目前有11個污水處理廠做監測，每個月都會採檢2次並送驗，除了小兒麻痺之外也有檢驗腸病毒，作為每年和一般的診所醫院來比對，是否跟收集到的病例一致。

莊人祥指出，由於從污水檢測出來的Ct值都在33到37之間，顯示這些病毒不具有傳染性，且是經過水，不是高度濃縮後被檢測到。

指揮官陳時中提醒，但這裡可能曾經有確診者，或是現在有確診者在，因此將根據流域分佈來設立採檢站，及早把沒有症狀的人找出來，是目前最重要的工作，也會持續做。