政委唐鳳推出的「實聯制簡訊」，近來遭到質疑，相關資訊作為非防疫疫調所用。指揮中心指揮官陳時中表示，實聯制簡訊不會有不適用問題，電信業者僅能保留28天，供指揮中心也是只做疫調使用，不會把個資留給店家。

為了充分方便一掉，行政院五月中推「簡訊實聯制」系統，並整合五大電信商，讓民眾們掃描QR Code後快速開啟手機簡訊、自動帶入場所代碼，然後透過傳送到1922，完成實聯登記。

不過，澎湖縣5月底爆出首起本土確診病例，該確診婦人一度病況嚴重，入院即昏迷插管，無法配合詢問做疫調，最後採手機定位及訪查親友等方式拼湊出足跡，澎湖縣衛生局曾請教中央流行疫情指揮中心，得到回覆是實聯制資訊龐大，如何用於疫調仍在研議，使用上有困難。讓人不免質疑，實聯制在疫調上難以發揮作用。。

對此，指揮中心29日表示，簡訊實聯制推出，為方便民眾及商家落實實聯制措施、減少紙本紀錄的接觸，並有助於疫調人員掌握個案相關活動史及匡列接觸者等，相關數據之使用，均有其合法性、正當性、必要性，且絕無違法情事。

衛福部指出，依《傳染病防治法》第37條第1項第6款，公告「嚴重特殊傳染性肺炎第三級疫情警戒標準及防疫措施裁罰規定」，規定外出時應全程佩戴口罩，並配合實聯制；行政院為遏止疫情擴散，並減少實聯制紙本填寫之接觸，推出「簡訊實聯制」，供民眾及商家使用。

此外，指揮中心表示，簡訊實聯制係於經得使用人同意下，掃瞄QR code即完成實聯制措施；而「簡訊實聯制」並不會留下個資給店家，所留下的活動史簡訊，電信業者也只保留28天，且僅供指揮中心疫調使用，不會做目的外利用。
 

在疫調工作中，衛生單位人員須掌握確診個案相關之活動資訊，以即時展開接觸者匡列、環境清消等各項防疫措施，故適當的運用簡訊實聯制相關資訊，對防疫推動有實質的幫助。
 

指揮中心也表示，簡訊實聯制從2021年5月19日上線後，6月3日起啟用實聯制資料調用機制，以供地方政府衛生局有疫情調查需求時，向指揮中心申請調閱，經審核通過後將調閱資料回復，大多數申請調用案件可於一日之內提供資料。截至6月29日，已有宜蘭縣、花蓮縣、南投縣、屏東縣、苗栗縣、桃園市、高雄市、基隆市、新北市、新竹縣、嘉義縣、彰化縣、台中市、台北市、台南市、澎湖縣，共計16縣市政府衛生局調用303項資料，調用量前3名依序為桃園市衛生局、高雄市衛生局、台中市衛生局。
 

指揮中心強調，「簡訊實聯制」的推出，主要為提供民眾、商家、衛生單位不管是在配合防疫措施或執行疫調工作上便利的平臺，籲請民眾、商家配合，也請地方政府加強稽查，共同落實實聯制，完備疫調工作，達到防疫的目的。