指揮中心宣布3級警戒延長至26日，但13日起部分活動可鬆綁微解封。澎湖縣政府遵從防疫指引，將有條件開放餐廳內用，更決定空運每日加開2班、恢復七美至高雄航班，維持進入澎湖機場強制快篩；海運部分由於客流量大，繼續採取封鎖政策。

澎湖縣政府發言人陳其育9日宣布，因應指揮中心鬆綁措施指引，自13日有條件開放餐飲內用，必須在確保防疫情形下，包括實施用餐梅花座、架設隔板、保持1.5公尺社交距離、進行時間及人流管制等。若遭相關單位查獲違規項目一律停止營業。換言之，澎湖縣內各大海鮮餐廳只要做好防疫規定將可開放內用，民眾有機會到澎湖大啖海鮮。

另外，為因應微解封後的交通疏運，澎湖的航空運輸自7月13日起，每天增開台北、高雄各1班飛機，未來再視運量需求調整增加班次。海上客運部分，由於遊客數龐大，7月26日之前維持全面暫停，同時機場入境強制快篩仍持續進行，至於七美民眾要求恢復德安航空七美至高雄的班機，縣府同意在高雄機場端，先做好旅客的快篩後，即可恢復航班。

另外也將開放圖書館讓民眾在戴口罩、維持社交距離的防疫準則下使用。運動場館部分，小巨蛋、羽球館開放4分之1量能，供民眾使用，游泳池仍關閉。戶外的部分，包括籃球場、棒球場、網球場、公園則開放民眾使用。至於民眾最關心澎湖海域活動及海上遊樂設施，則一律停止，並未對外開放。