國內民眾6月7日起，接種新冠疫苗不必負擔費用，但引來基層診所炸鍋，不滿「政府請客、院所買單」，要求加補行政費用並即時發放。對此，中央流行疫情指揮官陳時中22日坦言現行補助「不合理」，除了處置費維持每人100元，行政費將從每人40元提高到100元，診所每月施打超過500人，將另發1.5萬元獎勵。

近期不斷有基層醫師反映，診所協助疫苗接種，政府只給每人100元處置費，又取消收掛號費，導致院所虧本施打，政策極不合理。對此，陳時中昨（21日）強調，還有40元行政費，若民眾打疫苗剛好有其他症狀看診，也可收取掛號費，但此說法再度點燃基層怒火，有醫師痛批「提供專業服務被當請客。」

對此，陳時中22日從善如流，強調疫苗整體施打率提高，醫療院所負擔加重，根據醫師公會、基層公協會反映，認為行政費只補助40元，跟原本掛號費差距過大，「我們也思考，確實有不合理的地方。」為此，即日起行政費將調整為每人100元，處置費維持每人100元。

另外，針對基層醫療院所協助施打疫苗，原就規畫獎勵措施，每月施打超過1000人發放3萬元，超過1600人發放6萬元。陳時中表示，考量有些診所規模沒那麼大，要達到人數很困難，但這些診所對於增加疫苗可近行也很重要，因此增列一個級別，每月施打超過500人，可領1.5萬元獎勵。

至於行政費和獎勵提高，是否回溯處理？陳時中表示，要回溯有點困難，會再討論一下，公布實施日期，從實施日開始計算。另外，發放速度也會加快行政流程。

外界質疑，基層院所已抱怨一段時間，為何現階段才宣布增加補助？陳時中說，因地方和公協會反映，確實有道理，加上整體施打量增加，對院所是一個負擔，需要增加醫些人力，甚至往後來看，全台需要更多施打點，必須有符合成本的給付方式，才能讓更多醫療院所加入。