長榮航空1周內出現連續3名機師確診，且都是突破性感染，3人都曾飛過美國芝加哥，也都屬於777機隊。長榮航空為防出現破口，4日上午宣布，擴大各機隊全面普篩，預估將有1200多名機師接受篩檢，即日起台北飛芝加哥航線暫停提供客、貨機飛航服務，恢復時間將視檢疫規範調整再行決定。

長榮777機隊幾乎都是歐美長程航班，包括芝加哥、紐約、多倫多、舊金山、休士頓等，歐美機場普遍有機場人員未戴口罩的問題，引發感染破口疑慮。據了解，3名確診機師都是777機隊成員，也都有飛芝加哥航線，長榮航空4日起對777機隊機師進行全面PCR普篩，人數約有800多人，和3名確診機師接觸過的機隊機組員、長榮航空員工也都要普篩，希望能夠抓出黑數。

另外，長榮航空也配合指揮中心，4日起對芝加哥航線啟動加嚴措施，除了匡列近300名機組員進行PCR檢測，安排至集中檢疫所，從芝加哥返台也都要入住集中檢疫所14天，回推14天內曾飛過芝加哥的機組員，也都被長榮召回檢測，包括機師和空服員。現在長榮北部檢疫場地都已住滿，有些組員甚至得到中部居住。

長榮航空4日早上進一步表示，即日起擴大進行各機隊飛行員PCR普篩，此外為配合檢疫規定、讓飛行員做最有效的派遣，即日起台北飛芝加哥航線暫停提供客、貨機飛航服務，恢復時間將視檢疫規範調整再行決定。

對於機隊普篩，桃園市機師職業工會理事長李信燕表示，雖然機隊跟機隊間不會互相在飛機上接觸，沒有跨機種飛行，但還是有共同相處的地方，例如報到中心等。因此，對同一機隊普篩是謹慎做法，「但如果能全公司普篩更好」，畢竟若知道內部有無其他感染練，能讓機組員更加安心。