2021年公費流感疫苗10月1日開打，台北市長柯文哲上午戴著「同胞須團結」口罩，帶頭示範接種流感疫苗，現場還有一對父母帶著幼兒施打，小朋友的疫苗是打在大腿上，他在眾人安撫下挨針，但還是嚇到大哭，模樣逗趣可愛。

柯文哲呼籲，65歲以上長者和6個月以上、6歲以下幼兒、慢性病及重大傷病高危險群能打就趕快打，因為現在新冠肺炎疫情尚未停歇，民眾如果感冒、呼吸道感染，到醫院就醫第一時間就會被要求篩檢、隔離，整個過程會拖延到就醫時間，這階段希望大家務必要去施打流感疫苗。

台北市舉行四價流感疫苗開打記者會，柯文哲表示，最近他看過一個統計數字，北市去年以前到院前心臟停止的病人存活率很高，但這數字從去年開始下降，主要是急救時，醫護人員要戴口罩、面罩、做CPR，相對時間就會延誤。

柯文哲說，目前民眾若有上呼吸道症狀，到醫院後，就可能被懷疑是感染新冠肺炎，在還沒看醫生前，就要先做一大堆檢查，整個醫療流程一定會變慢。

他舉例說，就像當年在台大醫院，有名孕婦在SARS最流行期間緊急到醫院生產，因她有感冒發燒症狀，醫院如臨大敵，最後這名孕婦還是死亡，當時他很納悶，醫院有葉克膜，急救都很快，怎麼還拖到過世？最後他才知道原因就是這位孕婦無法排除感染SARS，醫院篩檢過程拖了很多時間。

柯文哲要大家放心，因為流感跟新冠肺炎是兩種不同濾過性病毒，只是施打日前要間隔7天，避免免疫系統受到干擾即可。

北市府預估，今年預期施打的人數會比較多，台北市會分2階段進行，10月1日開始先讓65歲以上、18歲以下民眾、孕婦、醫事人員、慢性病患優先施打；接著是10月15日起由50歲到65歲族群接手施打。另高中職以下教職員、托育人員、市政府臨櫃人員等，市府會額外安排施打。

柯文哲說，65歲以上長者若沒有施打肺炎鏈球菌疫苗，北市也開放還可以跟流感疫苗一併施打，兩者沒有衝突。