陽明交大在今年2月1日揭牌正式合併卻爭議不斷，繼日前LOGO風波後，今天（28日）又有12位教授聯名質疑校長林奇宏任命高達52個體制外主管，不僅導致組織虛胖，且編制外的「校務長」又兼任公司獨立董事，如何維繫校務運作正常？最嚴重的是，有系所主管反映要見到校長必須逐級呈報，抨擊校方正在打造一個層級嚴謹的官僚制度，嚴重侵蝕大學應有的自由校風。

涵括工學院王彥博、林健正、蔡春進、劉典謨、理學院吳金典、洪慧念、莊振益、人社院林珊如、資訊學院林盈達、管理學院林義貴、資訊學院邱維辰、客家學院許維德等12位教授，在聯名信中表示，校友及師生曾對人事亂象提出建言，但校長林奇宏2度以2校磨合為由，宣稱副校長與編制外主管人員「沒有超越編制之情事」，甚至刻意隱匿存在「隱藏版副校長」，完全沒有檢討改進之誠意。

信中抨擊指出，合校至今林奇宏還在持續任命編制外主管人員，並突發奇想「由副校長兼四長」，以致教務長及國際長因被降級為副主管而辭職，這種做法對當事人極不尊重。

連署教授認為，校長先後自創及任命高達52個編制外主管職銜，種類及數量之多，令人眼花撩亂，且較台大、清大及成大等國內頂尖大學，陽明交大主管人數高出2到3倍，導致疊床架屋、組織虛胖及缺乏效率的官僚文化。

連署書更批評，編制外的「校務長」一人之下，眾人之上，統籌校區一般行政、主持主管會報、核閱公文，實務上等於原兩校地「校長」，卻又兼任公司獨立董事，是否妥當自有公評，唯此惡例一開，何以維繫校務正常運作？

此外，有系所主管反映，想要見到校長必須逐級呈報，每一層級又都像是幽靈關卡，提出的方案隨時可能遭到否決。他們質疑，陽明交大正在依據官場上「階級服從」的原則，打造一個層級嚴謹的官僚制度，嚴重侵蝕大學應有的自由校風。

連署書並爆料說，校長任命自己的學生當研發主管，又恣意大肆封官晉爵，以校務基金廣發主管津貼，假借校長的權力圖利行政團隊，另校長遴選委員7位教師代表中，有3人擔任校長指派的行政要職，授與受兩者似都欠缺利益迴避的高度警覺性，難脫瓜田李下之嫌。

連署的教授指出，他們最不願見到「裙帶關係」與「校園政治」演變成為校長遴選綁椿、酬庸及利益交換的工具，一旦校園文化與價值觀崩壞，絕非陽明交大合校之福祉！目前「國立陽明交通大學組織規程」已經校務會議通過，他們呼籲校長應該恪守法治精神；倘若校內自律明顯不足，則教育部、立法院與監察院應善盡監督的責任，終止人事與行政亂象，讓校務運作早日回歸常軌。