菲律賓外交部5月31日揭露，曾於4月13日針對中國海警船刻意騷擾台灣的「勵進號」一事，召見中國大使館的外交官，表達嚴正抗議。菲國聲明指出，中國海警船刻意靠近正在做科學研究的船隻，並不符合國際法上「無害通過」的要件，也侵犯菲律賓的海事管轄權。

「勵進號」3月至4月曾於南海進行海洋研究，船上也有菲律賓科學家。

根據亞洲海事透明倡議組織（AMTI）的最新報告，中國海警船過去兩個月以來，三度在菲律賓的專屬經濟海域內「挑戰」了海洋研究和碳氫化合物的探勘任務，受影響的包含台灣的「勵進號」（RV Legend）、挪威的「珊瑚號」（Geo Coral），以及菲律賓的M/V DA BFAR研究船。

報告指出，台灣「勵進號」3月15日在菲律賓巴布延島（Babuyan Islands）西北外海展開研究，23日抵達呂宋島西北邊60浬處。中國海警船CCG 5203原本在南沙群島的美濟礁，隔天就來到呂宋島附近尾隨跟蹤勵進號，迫使台灣政府陸續派出三艘巡防艦，前去驅逐中國海警船。

4月6日，勵進號再次赴呂宋島西北外海稍遠處進行研究，並由菲律賓的巡邏艦卡彭斯號（BRP Capones）伴航；此時，中國海警船CCG 5203又對兩艘船展開盯梢。3天後，勵進號返回台灣，才暫時結束這場「貓抓老鼠」的遊戲。

據美聯社4月初的報導，中國連續好幾天近距離盯梢台灣研究船，雙方相距僅2到3浬（約3到5公里）。菲律賓研究人員狄馬蘭塔（Carla Dimalanta）表示，當時團隊正在牽一條海底纜線，中國海警船太靠近，也引發科學家擔憂。

勵進號的研究計畫由菲律賓大學國家地質科學研究所和台灣國立中央大學共同參與，目的是策繪外海斷層，並尋找可能引發地震和海嘯等災害的地質特徵。該計畫資金來源部分來自菲國科技部，原定於4月13日結束。