立委提出《軍審法》廢掉之後，近5年來有32件不論是衛哨、抗命、逃亡、妨害性自主等，有9成都無罪或緩刑易科罰金，「這叫部隊怎麼管，一管下級就告你！」詢問邱國正支不支持恢復《軍審法》？邱國正表示，「我個人當然贊成」，他認為這對於領導統御各方都有利，也不會說會造成濫用，依照程序走的話，軍法就不會濫用。

立院外交及國防委員會9日邀請國防部長邱國正報告「國軍所屬空置土地、營區、訓練場地平日巡察維護作法及未來運用規劃」，並備質詢。國民黨立委吳斯懷質詢時表示，2013年7月洪仲丘案發生後，立院於同年8月三讀修正通過《軍事審判法》部分條文，現役軍人非戰時犯罪回歸一般司法機關追訴、審理。但許多軍紀案件遭輕判，導致基層幹部領導不敢管、不能管、管不動，對國軍士氣跟領導統御都有直接影響戰力；他並舉例，東引的二兵休假返台為了陪女友過生日，司法判沒有逃亡意圖無罪、關指部士兵在女排長的牙刷塗精液也無罪、裝甲旅官兵逾假記大過，乾脆跑回去上班，最後也是判無罪，這三個特殊例子。要求國防部長邱國正表態，是否同意恢復《軍審法》？

邱國正回應表示，「我個人當然贊成」，軍法當然是「利刃」，對領導統御是正面，但這有程序，他個人不能打包票，但內部管理跟領導統御問題，不能怪基層幹部，往往經驗不夠會遇到問題，但有違法犯紀就會依法來辦，該撤職、該汰除就馬上處理。

法律事務司司長沈世偉中將表示，偵查審判、監所執行他們現在都沒有在執行，以前都放在院檢，現在放在源頭，例如陸軍聯兵旅、海軍艦隊、空軍聯隊都有派法制官實施教育。