日本東京羽田機場2日下午5點55分，1架載有367人及12名機組人員的日本航空班機和日本海上保安廳的飛機相撞，客機17人受傷，但海保廳機上5人罹難、機長重傷。日本國土交通省2日晚間召開記者會，將此事定調為「飛安事故」，日航的常務執行役員青木紀将向罹難者家屬道歉，同時也強調516航班已獲得機場的降落許可。

NHK報導，日本國土交通省、海上保安廳2日晚間9點15分舉行記者會，國土交通省民航局局長平岡成哲表示，事發原因將交由國家運輸安全委員會調查，也會盡全力搶在今晚以前恢復營運。平岡成哲指出，516班機降落時，機場跑道上有架日本海上保安廳的飛機，隨後發生了碰撞事故，目前還無法確認事故發生主因。日本國土交通省也說，在這起事故當中，日航客機是正常著陸。

日航常務執行官青木紀正表示在記者會開始時，先向大眾致歉，表示對於乘客和相關人員造成不便深感歉意，也對逝去的5名海保廳人員表示哀悼。

青木紀正也指出，事故發生的地點是在跑道上，而516航班在降落以前，已有獲得機場方面的降落許可。他也認為，與航管的溝通可能是此次事故的主因，但也坦言目前不便多作回應，因為仍在調查當中。

至於日航是否知道跑道上有海保廳的飛機，日本航空常務執行官堤正之表示，「當飛機正常接近跑道並開始正常著陸時，發生了撞擊」，至於當時機長是否知道這就是海保廳的飛機時，「我們正在調查，但據我所知，我們沒有發現任何情況」。

針對此起事故對日航所造成的影響，青木紀正表示，為了避免減少影響，將會在明日提供更多更詳細的訊息，但也坦言對管理會有影響，也表示正在針對事故所造成的金額進行估算。

Live ATCのアーカイブより（他滑走路の交信有）
・JAL516着陸許可復唱
・海保機へC5へのタキング
・JAL166へ離陸機がいるため減速して進入継続
の交信はあるが、海保機への滑走路手前待機(Hold short of RWY34R)、滑走路への進入(Line up and wait)はこれからは聞き取れない pic.twitter.com/I8U1yagUDS

— ハム (@fightersfav) January 2, 2024

根據航空交通網站LiveATC所記錄到的場管制內容，當時東京塔台曾向海上保安廳的巡邏機發出指令，要求該機（呼號：722A）前往滑行道C；日航516航班（呼號：JapanAir 516）則獲得東京塔台的著陸許可（cleared to land），可在34R跑道降落。東京塔台再指令722A滑行到等候點C5等候，為第1架等候的飛機。

隨後，無線電未再出現兩機對話，但另一客機（JapanAir 131）向控制塔報告說，34R跑道發生火警。塔台隨即要求該機停在原地等候，並指令正準備降落的其他客機（JapanAir 162、JapanAir 166）執行復飛程序。

東京塔台立即用無線電向所有飛機進行廣播，說明34R跑道發生意外，要求多架航機停在原地等候。隨後又廣播表示，羽田機場全部跑道均須關閉。