中國與菲律賓的南海之爭從主權延燒到環境，中國自然資源部8日指控，菲律賓軍艦長期在南沙群島仁愛礁（仁愛暗沙）「非法坐灘」，導致當地珊瑚礁面積驟減。菲律賓隔天否認上述指控，反批中國才是真正破壞南海環境的罪魁禍首。

中國央視報導，中國自然資源部8日發布由南海生態中心與南海發展研究院共同編製的報告，指責菲律賓軍艦1999年在仁愛暗沙「非法坐灘」，致該處的珊瑚礁面臨生態浩劫，覆蓋面積減少87.3%之多。

自然資源部官員表示，菲律賓坐沉軍艦的過程中，對珊瑚礁造成「毀滅性破壞」，船身的鏽蝕析出重金屬，抑制珊瑚生長，艦上人員活動及捕撈等，持續損害當地生態系統。

菲律賓1999年為了宣示對仁愛暗沙主權，故意將二戰時期的戰車登陸艦「馬德雷山號」（BRP Sierra Madre）擱淺於此，並派軍隊駐防，是中菲南海衝突的熱點區域。

菲律賓政府負責南海爭端的工作小組9日駁斥中國的指控，反批中國對海洋環境造成難以估量的破壞，危及自然生態棲地，並影響成千上萬菲律賓漁民的生計。而中國大規模在南海諸島填海造地，已破壞珊瑚棲地。

中國海警日前與菲律賓海軍在仁愛暗沙附近爆發衝突後，菲律賓總統小馬可仕表態願意降低緊張局勢，但馬尼拉當局又將戰場轉向生態環境，有意將中國破壞環境的舉動訴諸國際。

美國智庫「亞洲海事透明倡議組織」（Asia Maritime Transparency Initiative）的資訊顯示，中國在南海近30個島礁填海造陸，並在島上興建機場、港口、軍營或其他設施。