F-35戰機是目前全球最多國家引進的第5代戰鬥機，但F-35B垂直起降型還有F-35C艦載型與F-35A陸基型型號不同，並未內建25公厘機砲，F-35B和F-35C依賴腹部掛載的吊艙增置機砲功能。不過其實，F-35B和F-35C的機砲吊艙也不相同，且無法互換，因為2種機型結構上存在顯著差異，凸顯F-35系列3個型號「相容率比想像中低」的問題。

美國軍聞網站The War Zone報導，根據近期的採購公告，美軍計畫向通用動力公司（General Dynamics）採購更多GPU-9/A和GPU-8/A型號的機砲吊艙，表明這2款吊艙的存在。這2款吊艙都可搭載4管25公厘GAU-22/A轉管式機砲，可攜帶220發彈藥。

有些消息來源曾將GPU-8/A機砲吊艙，誤認為替F-16戰機開發的30公厘機砲吊艙，顯然是將搭載GAU-13/A機砲的GPU-5/A機砲吊艙混淆。GAU-13/A機砲是GAU-8/A復仇者機砲的衍生型，GAU-8/A機砲主要裝備於A-10攻擊機。

1份由非營利組織「政府監督計畫」（POGO）獲得並於2月公開的聯合攻擊戰鬥機計畫報告，也證實了這2款吊艙的存在，並指出它們不可互換。這份報告由五角大廈測試及評估部門編寫，雖然有部分內容被遮掩，但仍有可見的內容提及：「F-35B和F-35C均可使用外掛於機腹中心線的GAU-22/A機砲吊艙。吊艙外部線條和掛載結構的差異，讓這些吊艙各自專屬於其型號（也就是說F-35B的機砲吊艙無法掛載於F-35C上）。」

雖然GPU-8/A和GPU-9/A型號的機砲吊艙都搭載相同的機砲和彈藥，但從現有的照片來看，2款吊艙的外觀幾乎相同，目前尚不清楚它們的整體共通性有多高。

F-35A型號內建GAU-22/A機砲，由於設計和安裝問題，F-35機砲無法擊中目標，導致F-35殺傷力受到影響。吊艙機砲很大程度上避免內置式GAU-22/A多年來所面臨的問題，不過，所有F-35型號的頭盔顯示器（HMD）相關問題曾影響機砲準確性，據稱這些問題已解決。

至於其他火砲問題，像是2021年，1架美國陸戰隊F-35B在吊艙機砲開火後不久因25公厘砲彈爆炸而受損，但具體原因仍不明。同年，另1架陸戰隊F-35B在皇家海軍航空母艦「伊麗莎白女王號」（HMS Queen Elizabeth）上執行任務時，因吊艙機砲出現未明問題而迫降於日本嘉手納空軍基地。

目前可以確定的是，2款機砲吊艙的存在顯示F-35系列B、C型號與A型號之間的顯著差異。儘管3者外觀相似，且共享部分研發成果，但實際上3者僅約20%的零件通用。特別是F-35B，其設計獨特，包括整合的升力風扇、可調節排氣噴嘴、大幅減重的核心結構，以及比A型和C型更小的內部武器艙。B型還包含1個自動彈射系統。

型號專屬的機砲吊艙也凸顯F-35系列有限的通用性在維護、後勤和支援方面造成的問題。缺乏互換性意味著操作F-35B和F-35C的單位，至少在吊艙方面，無法共享通用的備件庫存。

F-35系列備件和供應鏈問題，這些問題因3個型號的差異而加劇，可能對高強度作戰期間產生重大影響。即使在例行演習和和平時期部署中，這些後勤系統的複雜性也已造成障礙。美軍已充分認識到這些問題，但長期以來難以有效解決。