考慮到「台灣有事」等突發事件，日本防衛省計畫撥款726億日圓（約152自新台幣），在2025財年結束前，將14處自衛隊指揮中心遷至地下，以在台海衝突或其他緊急情況下，更好地保護重要設施。

日經亞洲4日報導，日本防衛省在2025財年的預算提案中，為這項計畫編列726億日圓（約152自新台幣），是截至今年3月的本財年的8倍。除11個預計在2024財年底完成地下化工程的指揮中心外，北海道及靜岡的航空自衛隊基地，還有1處海上自衛隊地區指揮部也被納入計畫範圍。

報導指出，地面指揮中心更容易受到攻擊，例如俄羅斯在2022年初入侵烏克蘭時的行動，被遷移的基地包括位於沖繩的設施，該地接近台灣，若中國以武力統一台灣，沖繩可能成為日本防衛的前沿。

航空自衛隊西南地區指揮中心目前設在那霸基地。如果該指揮中心失去功能，日本的空防優勢將受到削弱，使其陸海部隊更易受到空中攻擊，進而可能導致敵軍登陸日本領土。

那霸基地的部分自衛隊醫院設施也將作為重建計劃的一部分遷至地下。防衛省和自衛隊計劃將該醫院作為重要的地區醫療中心，用於救治受傷人員，同時預期其還能作為後勤支援基地。

目前一些主要的自衛隊設施已位於地下，包括位於東京市區市谷的防衛省總部中央指揮所，以及橫須賀的海上自衛隊作戰中心。