第2屆「台日海洋事務合作對話」19日在圓山大飯店展開為期2天的會議，預期將會針對台日雙方漁業合作、海上急難救助及「沖之島」附近海域漁權等問題進行討論。而台日關係協會會長邱義仁開幕致詞時表示，「台日雙方海洋之間問題滿多，但相信透過對話，台日間海洋問題終將解決。」

2016年10月31日第1屆台日海洋事務合作對話會議在東京舉行，2017年19日、20日移師台北圓山飯店舉行。雙方預計20日會後將簽署有關台日海上急難救助合作的瞭解備忘錄，以加強雙方海巡單位在船隻急難救助的合作及資訊交換。

而此次台灣代表團由台灣日本關係協會秘書長張淑玲擔任團長，會長邱義仁擔任顧問並列席指導，行政院農委會漁業署、海岸巡防署、科技部及外交部也派員與會。另外，日本代表方面，除日本台灣交流協會會長大橋光夫，日本外務省、海上保安廳、水產廳、文部科學省等官員也到台參加會議。

邱義仁開幕致詞時說，台日間距離很近，「海洋之間的問題也滿多」，台日間海洋議題涉及漁業糾紛、海上救難、海上共同執法打擊犯罪與科學研究調查等，這些都值得雙方推動合作，「也很容易產生摩擦跟糾紛」。

邱義仁進一步表示，雖有這些困難與挑戰，但基於台日雙方友情與共同戰略觀點，相信透過對話，「一步一步，最後可以得到解決」。

日本台灣交流協會會長大橋光夫則表示，「近年來日台關係在彼此深厚友誼與信任關係基礎下，在貿易、投資、觀光等方面交流有很大進展；日方期待加強海洋合作，促進日台雙方漁業從業人員生活與安全互惠關係。」

大橋光夫表示即便是複雜的問題，如果雙方能站在大局角度，相信「一定能夠加以克服」，回應日台人民期待。他以2013年日台簽署漁業協議，雖歷經17年，協商遇到許多困難，但日台雙方秉持毅力、不斷談判，終於簽署協議。

而針對外界關注的「沖之島漁權」問題，2016年第1屆時台日雙方當時沒共識，台灣代表團當時曾抗議日方扣捕台灣東聖吉16號等漁船及希望索回東聖吉16號遭日方沒收的訴訟保證金，但日方則重申擁有「沖之鳥」專屬經濟海域立場，而預計此次會議將再度觸及沖之島議題。（請蔡政府硬起來護漁權）