「美台國防工業合作會議」是在2002年小布希政府任內創立，我方時任的陳水扁總統定位為兩國在國防合作上的另一軌道，從小布希政府宣布售台柴油潛艦等三大軍購案，陸續宣布的海軍潛艦使用的重型魚雷與潛射型魚叉飛彈，以及陸軍的阿帕契直昇機等重大軍售案，因此第一次會議是由時任的國防部長湯曜明出席會議並發展演講，而開啟了台美正式的華美會議之外的溝通平台。

但是隨著政治環境的變化，陳水扁總統在國內推動「公投入聯」，被美方認定是踩到兩岸的「紅線」，不但在當年的美台國防工業會議都只是就亞太戰略情勢與解放軍發展進行研討，對於軍購的議題是無所進展，就變成類似單純的智庫的會議。

2008年馬英九總統執政後，為向美方表達未來兩岸走向和緩路線，也是由當時的國防部長陳肇敏前往參加並發表演講，隔年就進入實質的軍購議題，但是隨著歐巴馬政府對中國同時採取合作路線，甚至在2012年國務院與國防部都沒有高階官員參加，被解讀這項會議已逐漸式微僅具象徵意義，並沒有另一溝通軌道的功能。

就因為美台國防工業合作會議是民進黨執政期間創立，在馬英九執政期間，民進黨仍可以透過該會議，直接與美方政府人員溝通國防事務，以及讓美方瞭解民進黨的國防政策規劃。

雖然去年時任民進黨秘書長吳釗燮率領國內由21家造艦、航太與資安產業組成的隨行團，向美說明未來民進黨執政後的國防自立政策，也全力推動台美國防工業合作，跳脫過去台美國防合作僅侷限在政府對政府，希望推動民間對民間管道。

雖然今年再次政黨輪替，蔡英文總統執政，基於這還是民進黨的場子，未來政府推動潛艦國造的期程中，該項會議將會因執政者的重視又付予新的角色。

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