足協原訂17日召開會員大會進行理監事改選，但因之前召開理監事會及審查參選人資格過程出現爭議，國際足球總會（FIFA）於12日晚間來函足協建議暫緩選舉，14日足協副理事長龔元高和高雄市足球委員會主委劉世芳公布FIFA該封發文足協函文，足協隨後表示，將依FIFA建議暫緩改選，但17日改開緊急會員大會，不過，居中協調多時的體育署亦在14日正式行文足協，明確表示，「爭議事件尚未釐定前，為避免衍生其他新爭議，請貴會立刻暫緩第12屆第1次會員代表大會並暫停理監事選舉。」

體育署在14日發給足協的函文中表示，「近日，貴會辦理監理事會選舉及選務小組審查參選資格，涉及人民團體法等相關法令之適用及國際足球總會之認定」，因此具體要求足協暫停17日召開正式會員大會和進行理監事改選。

足協17日改開「緊急會員大會」

不過，足協亦已在14日表示，將依FIFA的建議暫緩改選，另發出會議通知，17日改開緊急會員大會。不過足協聲明強調，根據足協章程第19條第1項所指，「會員大會為最高權力機關」，因此將於17日舉行緊急會員大會，由會員議決「是否開放非會員代表參選」的議題。

實際上，足協要在17日緊急會員大會討論此議題，針對性極強。足協原訂17日進行改選，而原本參選理事長人選除了現任理事長林湧成，另有台灣日本關係協會會長邱義仁，但邱義仁的參選資格遭足協內部自組的選務小組審查後認定「非足協會員」，不具有參選資格，另有多位副理事長和理監事資格亦在審查後遭認定不具參選資格，選務小組的審查結果引發爭議，雙方人馬各自引據足協章程和《人民團體法》相關規定自持己見，並各自行文FIFA，請世界足球總會處理。

FIFA隨即在3月9日發文足協表示，FIFA一直是非常小心地確保和堅持，所有會員協會都必須舉辦公平的、民主的和透明的選舉，事實上，FIFA的章程第19條第2款明確規範，「會員協會的章程必須規範一套民主的選舉程序，來確保選舉不會被操控……」，更重要的，在FIFA章程第19條第3款明確指出，「如果任何會員協會被選出或指派的會員代表無法符合前述第2款規定，……」，那麼選舉結果將不會被FIFA接受。

FIFA更進一步表示，「在這些情況下，我們徹底分析各方收集到的相關資料後，認為中華台北足球協會似乎並不是在進行一個民主的，有程序的，公平的和透明的選舉。」因此FIFA表示，「我們強烈建議中華台北足球協會暫停所有的理事會選舉相關工作，等待FIFA與AFC的聯合代表團來到台北，和所有相關單位商討和評估整個選舉狀況再做定奪」。

FIFA明確要求暫停選舉　17日決議恐不被接受

上有政策，下有對策，在FIFA和足協均行文建議，甚至要求足協暫停17日的理監事改選後，足協隨即再發文通知會員們，17日改開緊急會員大會，並表示要討論「是否開會非會員代表參選」議題，但副理事長龔元高表示，因FIFA的要求很明確，是所有有關「理事會選舉的相關工作」，這當然包括參選人的資格認定、審查問題，因此認為足協在7日改開緊急會員大會討論的議題，已違背FIFA的函文要求，17日緊急會員大會所做會員決議，極可能不被FIFA所接受。
 

龔元高並表示，依據足協章程，參選人資格是在理事會中審查，並非會員大會，會員大會僅就理監事會通過的參選人名單進行確認；足協堅持在17日召開緊急會員大會，要會員議決「是否開放非會員代表參選」議題，已屬於理事會審查參選人的職權，如果足協執意而行，堅持不照FIFA要求「暫停所有理事會選舉相關工作」的意旨而行，不等FIFA相關人員組成的聯合代表團來台再作為，則FIFA不僅可能不承認17日緊急會員大會所做議決，並給予懲處，甚至可能逕行接管，或給予會員停權待遇。