賴內閣宣佈新一波內閣人事調整，其中調查局長蔡清祥接掌法務部，原部長邱太三去職，傳出可能轉任總統府副秘書長。但據可靠消息指出，邱太三已向蔡英文總統婉拒這項職務，總統府副秘書長一職將另覓人選。而府方另行宣佈，邱太三將在近期內出任國安會諮詢委員。

行政院12日上午宣佈教育、內政、交通、法務及財政五部會首長異動，除了在行政院團隊內互調之外，原法務部長邱太三可望轉任總統府副秘書長，在此波人事調整中格外引人關注。然而據消息人士透露，邱太三對總統府副秘書長一職沒有意願，已經向蔡英文婉拒，府方原則上也已尊重並接受邱太三意願，將另覓人選。

早在數月前便傳出倦勤的邱太三，此次雖然在執政黨的政治考量下去職，但行政院長賴清德公開表示，蔡英文將繼續借重其兩岸國安專長。考量邱太三在法務部長任內，在推動獄政改革以符合國際人權標準、建立洗錢防制體系，以及維繫兩岸刑事合作及司法互助等成果，加上其在對岸學界及決策體系具有一定人脈，蔡英文也決定邀他進入國安團隊。而稍晚府方也證實，曾任陸委會副主委的邱太三將出任國安會諮詢委員，並將於近期上任。

在過去幾次內閣異動傳聞中屢遭點名的邱太三，在這一波閣員人事調整中確定去職。外傳邱太三去職主要原因之一，是他在任內未曾執行死刑，近來重大刑案頻傳，執政黨壓力大增，讓堅持法律程序完備才能執行死刑的邱太三成為眾矢之的。 

得罪扁遭深綠點名　恐是邱去職主因

然而據知情人士透露，死刑一事只是讓邱太三倦勤的原因之一，真正讓府院決定換掉邱太三的主因，來自邱太三對保外就醫的前總統陳水扁屢踩法律紅線的行為表達不滿所致。法學專家出身的邱太三，深知陳水扁處遇問題的政治敏感性，因此對法律與政治的權衡一直十分謹慎，在討論是否保外時主張尊重醫療團隊判斷，在保外之後則認為扁家及其支持者必須謹守規範。

自從接掌法務部之後，邱太三基於職責所在，主張必須守住法律底線，卻因此導致陳水扁及其支持者不滿，頻遭點名下台。事實上，私下談到陳水扁的言行時，邱太三也總是歎氣，直言自己的立場已經「得罪人」。

蔡英文與邱太三是台大法律系同屆同學，2016年蔡英文組成內閣團隊時，外界均猜測曾擔任陸委會副主委的邱太三將重回兩岸決策體系，出任陸委會主委。但當時黨內人士便明確指出，在野期間的蔡英文為了上任後推動司法改革，積極與法律學界與實務界人士接觸以傾聽專業領域意見，從中協助的核心「軍師」之一就是邱太三，因此邱太三勢必成為蔡政府首任法務部長，事後也證明此一說法無誤。