4年前在台北市長選舉前就已在海外出版著作《屠殺》，近期將在台灣發行中文版，出版社「蝴蝶蘭文創」在媒體刊登全版廣告摘錄書中內容，稱柯文哲帶病人到中國進行器官移植，且確知所有器官都來自法輪功；對此，柯文哲3日回應，「那個報導是不對的！」他甚至表示，「這個絕對不是吳祥輝自己出錢來刊登廣告」，認為該廣告版面至少要1百萬以上，重點是後面出錢刊登廣告的人是誰？柯說完還補了句，他知道吳祥輝只是打手而已，「反正他只是拿錢辦事嘛！」

《屠殺》4年前曾在國外出版，而當時正值台北市長選舉，當年柯文哲雖曾駁斥書中人物不是他，但沒想到4年後的市長選舉，這本書又即將在台上市，且在媒體刊登大版面廣告，以及附上出版社蝴蝶蘭文創負責人吳祥輝署名與作者授權書，內容稱柯文哲從台灣帶不知道是台大醫院或是他私自接觸的病人，到中國進行器官移植，並明確指出，「柯文哲確知：所有的器官都會來自法輪功。」

柯文哲上午出席秋祭活動，對於這本書在選前敏感時間再度出版一事，柯受訪表示，4年前他在電視辯論會時也是最後一秒才把作者的澄清信函拿出來，他說，作器官移植是很專業的東西，「這都很好查，所以那個報導是不對的！」柯文哲指出，當時作者有答應過，若那本書要再版的話他會修改，「問題是那本書賣得很爛，根本不會再版」，笑說，出版公司現在就是買那個沒有修改過的的中文版。」

柯文哲也說，法務局長剛剛有問說要不要提告，但他認為，這其實就是對方引誘他們去提告，「因為老實講，這個絕對不是吳祥輝自己出錢來刊登廣告，那個版面應該要100萬以上」，柯說，重點是後面出錢的人，「因為我知道吳祥輝只是打手而已」，批吳反正只是拿錢辦事。

由於器官移植都扯到兩岸一家親，記者也問，他是否覺得內容太偏頗？柯則語氣平淡說，台灣的選舉就是這樣，「泥巴戰嘛！」並表示他會跟律師、競選團隊再討論看看要怎麼辦；至於會不會覺得出錢的是中國？柯說，我怎麼會知道。