《公投法》門檻大幅調降後，首度碰到公投綁大選。中選會11日邀請直轄市、縣市選舉委員會，商討全國性公民投票投開票作業，最後決定採取「選舉領、投，公投領、投」2階段方式進行。

地方選舉委員會並建議，1案1張公投票方式，並統一使用白色紙張。目前中選會已收到10案公投案，均陸續送各地戶政事務所查對。

中選會11日會後表示，2018年地方公職人員選舉及全國性公民投票，選民先領9合1選票、投票，再領公投票、投票。至於開票程序，則先辦理地方公職人員選舉開票，再辦理公民投票開票。

公投併大選舉行，要採「一階段」還是「二階段」的投票方式，朝野曾有激烈辯論，依照過去6次公投案經驗，採2階段領、投票，可以降低「公投綁大選」連帶效果，但也容易導致選民只投選舉票，使得公投案通過的機率降低。

中選會副主委陳朝建解釋，選舉需年滿20歲，公投則年滿18歲就可投票，選民資格並不同，「所以一定要分開來領投票」。另外，為確保選務順利，一定要先完成9合1的開票，再開公投票，期望能在深夜前完成為目標。

中選會表示，公投案將採3案或4案投入同一票匭，開票方式以公開、透明、民眾信賴為原則，開票時先依案別及同意票、不同意票進行分類，然後計票。

地方選舉委員會建議採白色印製公投票，因為此次公投票數量多，採1案1張公投票方式，如採不同顏色，色紙備紙不易、印製時間長、成本也高。中選會表示，公民投票開票進行程序及公投票顏色，將提報該會委員會議審議決定後據以辦理。

目前中選會已收到國民黨遞交的反空污、反核食、反深澳燃煤電廠三案；下一代幸福聯盟的婚姻定義公投、反同志教育、同志專法三案；挺同團體的婚姻平權、性別平等教育的兩案，另外，還有東奧正名公投，以及核養綠公投，總計10案公投案均已陸續送各地戶政事務所查對。（「山竹」目前仍持續增強）