馬偕醫院新任院長張文瀚原預計11月上任，不過16日卻遭基督教長老教會總委會否決，台灣百合正義會指原因是與張文瀚涉及與前董事長劉伯恩以馬偕名義在外設立3間公司有關。

對此，劉伯恩則向媒體表示，張文瀚是董事會合法選任的院長，適不適任外界自有公評。衛福部則指出，尚未收到遴選相關申訴，且除非過程有違反程序，否則也無法介入。

台灣百合正義會指出，基督教長老教會總委會16日針對張文瀚當選馬偕醫院總院長職務一事是否任用提出公決，長老教會認為張文瀚醫師因涉及多項違法亂紀之事，其中，張文瀚疑似涉及與馬偕醫院前董事長劉伯恩以馬偕名義在外設立3間公司。

台灣百合正義會指出，張文瀚稱私設公司是為了活絡資金管道，事實是違反法令規定，這三家公司之盈餘某程度捐助總會或馬偕醫學院之說，根本與法令規定不符、且設立三家公司的章程，也對馬偕醫療財團法人不利。

台灣百合正義會表示，根據上述原因，長老教會總委會以21票反對任用、11票贊同任用、1票廢票，最終否決張文瀚醫師當選馬偕醫院總院長任命案。

馬偕醫院前董事長劉伯恩的知消息後表示，張文瀚確實是通過董事會資格審查、經合法投票程序遴選的院長，劉認為，長老教會現在才提出有瑕疵並不合理，外界自有公評。

衛福部醫事司司長石崇良也向媒體說，日前董事會已通知、完成下屆董事會改選，此次院長遴選人被長老教會否決，除非有特別違反程序問題，否則衛福部也無法可管，目前也尚未接到關於遴選院長的相關申訴。（韓國瑜粉絲團遭停權）