「反核食公投」獲得壓倒性支持，決定維持禁止進口日本核食。日外務大臣對此表示遺憾，宣稱不排除訴諸世界貿易組織（WTO）的爭端解決機制。我國駐日代表謝長廷29日表示，這是民主政治，大家承擔後果，也共同解決問題。

「反核食公投」主文為「你是否同意政府維持禁止開放日本福島三一一核災相關地區，包括福島與周遭四縣市（茨城、櫪木、群馬、千葉）等地區農產品及食品進口？」由中國國民黨副主席郝龍斌提出，24日以779萬票1856票贊成、223萬反對票過關。

我駐日代表謝長廷29日出席「台日經濟貿易會議」，會前受訪時強調，「民主政治就是這樣，謹慎去投，結果大家共同承擔，有問題共同解決，駐日代表處會全力以赴配合政策來解決問題。」

日外務大臣河野太郎對台維持禁令表示遺憾，不排除提交WTO進行爭端解決。外交部表示，對於日本食品進口管治議題，立場在於確保食品安全的前提下，依據國際基準、世貿（WTO）規範及科學數據妥善處理，並尊重食安主管的專業判斷。有關公投結果和日方可能採取的作為，外交部將進與日方進一步懇切溝通，謹慎處理，以尋求日方理解，避免影響台日關係。

日本駐台代表沼田幹夫日前也對台灣公投結果發表聲明，除深感遺憾，也說為了避免此問題被當作工具傷害日台友好，將繼續努力讓台灣朋友理解日本食品的安全性。

日本2011年311大地震引發福島核災，至今仍有台灣、中國、南韓等8個國家和地區禁止進口災區附近的農產品等。28日，中國宣布即日起允許日本「新潟米」進口，解除部分日本食品禁令，有日媒認為中國此時解禁應是想趁機拉攏日本。

2015年日本政府認為南韓禁止日本水產品進口違反國際貿易規則，向WTO提告，爭端解決小組2月裁定日本勝訴，南韓上訴中。（日本市長訪花博變極樂之旅）