行政院長賴清德11日內閣總辭，由蘇貞昌接任，並著手調整內閣人事。12日蘇團隊證實，農委會代理主委陳吉仲接任農委會主委。在面臨防堵非洲豬瘟的艱難時刻接下重擔，陳吉仲表示，「全力與蘇貞昌院長一起打拚。」

2018年蔬果價格崩盤，農民叫苦連天，加上九合一大選民進黨慘敗，許多農業大縣如彰化、雲林也從綠地變藍天，當時農委會成為究責對象之一。之後農委會主委林聰賢下台，由陳吉仲副主委代理主委一職。

面對林聰賢下台，陳吉仲曾說要與他同進退，如今被媒體問及留下來接下重任的原因，陳吉仲回應，他看到蘇貞昌院長意不計個人，來承擔國家重責大任，他就不會站在個人角度去思考去留，而是要站在國家的角度，自己就該全力與蘇貞昌院長一起打拚。

陳吉仲表示，11日晚間蘇貞昌找他面對面深談，問了很多有關非洲豬瘟的狀況，由於蘇貞昌之前也做過農業大縣的屏東縣長，所以對農業非常了解，他說，經過深切接談，蘇貞昌希望他能留下來打拚。

至於農委會目前面臨最重要的工作，陳吉仲指出，就是非洲豬瘟的防疫做好，「這是最基本的，而且是一定要做到的」；另外還有產銷、讓農民感受到收入增加，「農委會每個政策到農民身上有感，都是農委會重要的課題。」

除此之外，已確認蘇內閣「三長」，行政院副院長由陳其邁接任；台南市前代理市長李孟諺接掌行政院秘書長一職；政務副秘書長何佩珊留任。而前台中市長林佳龍則接任交通部長，現任環保署副署長張子敬接任環保署長。(蘇內閣遭諷敗戰者內閣)