促轉會日前向國安局調閱林宅血案、美麗島事件、陳文成命案等21件檔案，僅調到1件，其餘均被列為「永久機密」。對此，總統府發言人黃重諺12日表示，蔡英文總統非常關切檔案解密爭議，並指示總統府秘書長陳菊、國家安全會議秘書長李大維，隨即召集相關部門研議後續處理事宜。

黃重諺指出，國家安全會議將依據《國家機密保護法》及《促進轉型正義條例》等法律規定，督導國家安全局逐案重新檢視檔案的機密等級與保密期限，且在兼顧轉型正義及國家安全的前提下，將依法予以適當處理。

陳菊12日也於臉書寫下，林宅血案、陳文成命案、美麗島事件、台大哲學系事件等重大政治案件檔案，因為涉及國家機密一直無法公開。但是，在數十年的時空變遷之後，必須面對過去的傷痛，追求公義，把真相還給人民。

她表示，自己身為40年前美麗島事件的當事人，深刻體會白色恐怖、政治迫害給受難者和家屬所造成的傷痛。真相不一定可以水落石出，但對真相的堅持是對整個體制的深切反省。

陳菊強調，會請國安單位逐案檢視相關檔案，適時註銷或解除機密等級，以釐清、重建歷史細節，這樣，台灣民主才能深化，社會才能真正和解重生。

日前，民進黨立委段宜康在8日立院司法委員會中討論《政治檔案條例草案》，他質疑，國安局所掌握的林宅滅門血案、陳文成命案檔案，「為何不可以讓大家知道，為何不能解密？」也呼籲總統府應依權責將檔案進行解密；黃重諺12日強調，作為民主法治及落實轉型正義的國家，把該還原的真相逐一釐清，是政府應負的責任。。(中國武統學者李毅遭強制遣返)