高雄市長韓國瑜上任後力推設立自經區，卻引發許多爭議，有人質疑在陳菊執政時期也曾經推動自經區，如今卻出來反對是在自打臉。對此，陳菊7日在臉書發文解釋，「不同時空、不同目標的政策主張，不應該相提並論。」

陳菊更質疑，在中美貿易戰加劇的時刻，國民黨卻強打自經區，「除了政治目的、引發又一波的口水戰，實看不出對國家發展有何助益。 」

高雄市長韓國瑜上任後力推設立自經區，國民黨人士也紛紛出面力挺，並攻擊陳菊在任市長時也曾推動過自經區，還有人挖出時任市長陳菊的致詞片段，指陳菊曾說自經區是城市轉型的好機會等言論。

對此，陳菊7日在臉書解釋，在2014年陳菊市政團隊擔心當時國民黨中央政府急於向中國傾斜、靠攏的自經區規劃，會把高雄變成中國的加工出口區，反而對正在經濟轉型的高雄帶來嚴重傷害，因此，市府提出「三要一不要」的原則，包括要金融服務、要港區再造、要產業轉型，不要傷害農民的「農業加值」。

另外，自經區更必須符合程序公開透明以及建置產業、就業衝擊保障配套等原則，陳菊表示，若是違反這些原則的自經區規劃絕對不能接受。

陳菊指出，在中美貿易戰爭持續升高時刻重提自經區的主張，對台灣國內產品出口反而容易產生不利影響。尤其南部是鋼鐵產業重鎮，這類產品一直是美國持續關注的項目，「不同時空、不同目標的政策主張，不應該相提並論。」

陳菊質疑，國民黨刻意選在美中貿易戰升高的此時推動過去自己放棄推動的法案，除了政治目的、除了引發又一波的口水戰，「我們實在看不出來對國家發展有何助益。」（戴資穎續居球后）