民進黨總統初選由蔡英文總統出線，不過卻遭行政院前院長賴清德的支持者質疑民調做假，前總統陳水扁更直言，5家民調公司做出來結果都一樣，「阿扁打死也不相信。」台大政治系退休教授洪永泰也直呼，「民進黨中央黨部寫下了台灣民調史上最黑暗的一天。」

對於外界疑慮，民進黨17日下午特別發布Q&A新聞稿釋疑，強調此次民調的辦法、規則與執行方式，均為蔡、賴雙方事前同意，執行前各項作業由民調委員會審核驗證，執行中候選人雙方代表全程可參與見證，核算後民調結果與數據資料亦提供候選人雙方。如有任何疑義，候選人也可循申訴與調查機制來維護權益，此為公正公開的初選方式。

民進黨2020總統初選民調13日出爐，由蔡英文總統勝出，不過前總統陳水扁隨即在臉書發文表示他從立委時代就有自己的民調中心，加上各2次市長與總統選舉，對民調不敢說是專家，至少也有將近30年經驗，「從未看過5家民調結果是從一個模子印出來」，因此認為這份民調「絕對是抽樣題庫提供者中央黨部的母體出了問題」、「您相信嗎？阿扁打死也不相信。」

對此，民進黨強調，此次民調成功樣本高達3200份以上，且95%的信心水準下，抽樣誤差僅1.7%，「有相近的民調結果才顯見此次總統初選民調的品質值得信賴，如果五家單位的民調結果差異過大，那才是值得擔憂的事。」

另外，台大政治系退休教授、公民教育基金會董事長、曾擔任過國民黨「政情與選舉研究中心」召集人的洪永泰15日也在《遠見》精英論壇寫下「2019年6月13日民進黨中央黨部寫下了台灣民調史上最黑暗的一天。」

洪永泰認為，台灣民眾使用住宅電話和手機的結構比例並非相等，卻未根據樣本的人口屬性分層，然後各層之內再將住宅電話樣本分成「只用住宅電話不用手機」以及「住宅電話和手機都用」；將手機樣本分成「住宅電話和手機都用」以及「只用手機不用住宅電話」4個部分，依照各部分在台灣民眾中占的比例進行加權計算，讓他感嘆「這個烏龍絕對會寫入台灣民調教科書，永垂不朽！」

民進黨說明，市話調查常有年輕世代及男性接觸率較低的現象發生，分析本次總統初選結果發現，手機調查的加權前穩定度最佳，市話手機各半次之，市話較差，可見隨著手機使用愈普遍，手機調查在電話民調所占份量應當隨之提高。且民調中心分析本次初選民調資料後發現，無論是採用市話調查、手機調查，還是市話手機各半調查，結果都與本黨此次總統初選的勝負判定一致，換言之，無論採行何種市話與手機樣本比例，都不會影響本次初選勝負結果。

針對洪永泰認為此次初選民調是一大烏龍，民進黨則指出，民進黨的民調中心自2011年便在全國性民調中加入手機調查，每年均執行超過50次全國性電話民調，採行市話與手機各半的調查方式為經數據分析產出之作法，並非隨性所致，且經過多次選舉結果驗證可行。

民進黨也指出，洪永泰所稱各族群的比例僅是他個人的研究推估，並不是官方的統計資料，「洪教授的個人推估經過多少次實際調查或選舉結果驗證，可以證明是比較好的抽樣或加權方法，值得全國各民調單位統一採納應用，這是洪教授在指控別人民調烏龍前，應該先回答的問題」、「若洪教授如此重視抽樣理論，應該建議國民黨初選加入手機，否則他主張的那30%的『唯手機族』將無從表達意見。」

民進黨強調，這份民調表態率明顯較一般民調高，是因為初選民調有事先公布題目及執行日期，本來就不能當成一般的民意調查，且初選期間雙方支持者皆呼籲民眾在家顧電話，因此表態率較高或本黨候選人支持率較高，都是可以預見的。

民進黨也指出，初選結果並不代表2020年總統大選結果，選戰瞬息萬變，用初選結果推論近9個月後的選舉結果，然後質疑初選結果不準，這是無謂的預測。

另外，資深媒體人彭文正在臉書轉貼一位吳女士的控訴，表示她在初選時向訪員表示「唯一支持賴清德」，但訪員卻直接掛電話，導致她成為無效樣本；民進黨也反駁，在民調委員會調閱相關資料後發現，吳女士提供的市話號碼確實為這次初選民調的受訪樣本，戶籍在苗栗、唯一支持賴清德、年齡是50至54歲，而且是成功樣本，應為受訪者理解有誤，確認無任何作弊情事。（交通部喊：Uber可以一起贏）