秋行軍蟲疫情擴散，從8日首度發現幼蟲至今，已現蹤超過55隻成蟲，行政院農委會17日坦言，幾乎已不可能根治，因此宣布進入第二階段防疫，已現蹤的縣市全面強制噴藥，而尚未淪陷的基隆市、新竹市、南投縣、嘉義市4縣市，農委會也提醒，若發現卵、蛹、幼蟲、成蟲一定要通報，以免亂灑農藥，反而出現抗藥性。

農委會17日召開全國視訊會議，表示從8日出現秋行軍蟲幼蟲，後陸續在苗栗縣、嘉義縣、澎湖縣、新竹縣、花蓮縣出現成蟲，農委會坦言，現階段已幾乎不可能根治秋行軍蟲，只能與之共存，將傷害降到最低，防治措施得從第一階段的現地焚化、掩埋銷毀，來到第二階段強制噴藥，視後續疫情研判，第三階段就得靠農民自主管理。

農委會副主委陳駿季表示，當初用掩埋、焚燒是希望幼蟲不會孵化為成蟲擴散，如今要準備與秋行軍蟲共存，改以藥物防治，疫區管制期從3個月改為作物生長季結束為止。

農委會說明，管制區周圍會劃定緩衝區，巡察寄主植物是否有卵塊及幼蟲，施藥會輪流使用不同機制的藥劑，並列出賜諾特、諾伐隆、氟大滅、剋安勃、護賽寧、依芬寧、硫敵克、蘇力菌等共11種推薦農藥，但是不作休耕3個月的管制，依據採收前安全期停藥，仍可收成銷售；有機農田則可施用蘇力菌防治。

另外，民眾發現秋行軍蟲通報獎勵1萬元，仍維持至6月21日，若有發現秋行軍蟲蹤跡，可透過「防檢局防疫小尖兵臉書」、「防檢局LINE@」、「農作物天然災害即時回報APP」，或撥打防檢局通報專線0800-039-131，籲請踴躍通報。（台灣黑熊遭「山豬吊」夾前掌）