對於華航是否有涉及國安局香菸走私案，交通部長林佳龍23日嚴正表示，他已要求華航徹底展開行政調查，釐清疏失和責任。「證據到哪裡責任就到哪裡，人事檢討就會到哪裡。」

國安局官員透過總統出訪回國的禮遇通關，走私自華航購得的9200條免稅菸，不過，華航發言人劉朝洋22日指出，主要是為配合菸害防制法，對一般的班機並未開放菸品訂購，但專機或包機，只要有提出需求，就會開放，預訂方式與其他免稅品相同。

華航表示，買受人須符海關相關規定，超量者自行辦理申報。有關立委黃國昌指華航高層協助預訂9200條免稅菸品走私的說法，不符事實，華航並未給予協助。

不過，黃國昌23日又揭露，華航網站上根本沒有可以事先預訂菸品的選項，且在19日時，他就已掌握華航在總公司高層人員督導下，將這些菸品裝載入行李櫃中，並放置於保稅倉1樓的行李櫃運送車上，因此黃質疑華航公然說謊。

交通部長林佳龍23日在臉書提出三點指出，第一，他已要求華航徹底展開行政調查，也積極配合檢調單位偵辦，釐清疏失和責任；第二，關於這種違法行為，要求華航釐清歷年的狀況，並對外說明；第三，對於此案，他絕不護短，對於華航的疏失跟責任，「究責無上限」。

林佳龍23日受訪表示，他們不會只針對這一次事件調查，證據到哪裡責任就到哪裡，涉及到的人事檢討就會到哪裡。而針對華自行調查是否有「球員當裁判」的問題，林佳龍則表示，交通部身為主管機關會持續監督華航調查此事，並且同步公布給社會大眾，絕對不護短。（罷韓餐廳再開業！）