蔡英文總統27日解釋使用「超買」形容事件是為了尊重司法單位的偵辦，並強調不會去干預此案的偵查方向；蔡英文也首次因為私菸案而向大眾致歉，蔡表示，她為私菸案「沒有早一些被發掘、被改革」而表達歉意。

蔡英文27日出席總統盃黑客松頒獎典禮後，公開向媒體發表談話，說明總統府使用「超買」形容這次的事件，是為了尊重司法單位的偵辦，並且強調她不會去干預、干涉或定調此案的偵查方向或法令的適用

蔡英文說明，府方理解這個名詞使用導致社會質疑政府辦案決心，而他也鄭重向國人解釋，他們絕對有查辦到底的堅定決心。

蔡英文表示，因為此事件而挖掘出長期在系統裡存在的弊端，身為一個國家的領導，他為這件事沒有早一些被發掘、被改革，而表達歉意，並且重申把此案查辦到底、釐清責任的決心。

蔡英文說，在此案發生的第一時間，就接收到國安局長的請辭，並且火速調走侍衛長，接著總統府也已公布了新的懲處名單，共對1中將3少將分別記大過及小過，並且承認自己的監督管理「確實有缺失」。

蔡英文最後表示，她已經下令所有政府機關單位或個人，都必須要配合調查。蔡英文說，為了告訴國安特勤人員他們身負國家安全重任，必須要有高度的責任感跟榮譽感，並表示這次的事件必須要「深刻的反省、痛定思痛」，強調有錯就必須要改，讓社會能夠感受到，國安特勤人員盡最大的能力保護國家的決心。（台鐵又發生逃票攻擊事件）