私菸案爆發後，檢調持續進行司法調查，華航、華膳與國安局都分別對相關人員祭出行政懲處。檢調約談相關人員至今已逾131人次，檢方指出，目前交保或羈押者，是涉嫌重大或知情的人員。截至目前為止，除總統府侍衛室少校吳宗憲、張恒嘉遭收押禁見，當天逮捕的8人則以20-50萬不等交保，華航空品處代組長黃川禎則是20萬元交保、空品處協理于堯50萬元交保、前華航空品處副總邱彰信70萬元交保，由於華航前資深副總羅雅美與董事長謝世謙遭民眾按鈴控告，因而共列為被告，被告人數總共14人。

從目前偵辦過程可以看出，涉嫌重大者除了團購的總統府侍衛室、國安局本部、憲兵警衛大隊三機關76人外，還有華航空品處人員。至於華航其他部門的人員，還有華膳空廚也陸續遭到約談，以釐清私菸訂購的流程。然而，曾擔任華膳工會秘書長的中壢區立委參選人林佳瑋則表示，華膳公司負責華航免稅品的倉儲、運送，如此大量的訂購下，華航高層不可能不知情。

日前，華膳空廚總經理安隆祺曾發給內部員工一份聲明，表示從2016年起承接華航機上供應品，包含免稅品的保稅倉庫倉儲及運補作業。聲明指出，本次總統專機出訪團購菸品，是循往例保密辦理。安隆祺指稱願意承擔一切責任，華膳董事長葉菊蘭則表示，對走私菸品慣例不知情，但做管理保稅倉庫部分確實有疏失，會配合一切調查。後續，則傳出華膳餐勤部兩名主管遭記小過。

總統專機9800條走私菸　不照華航保稅品程序進出貨

林佳瑋於臉書公布華航免稅品的進出貨程序，她指出，華膳負責免稅品的訂購、運送及倉儲，一般流程為：華航採購後由報關行向海關申報免稅商品，海關核准後，華航就可將免稅品送入保稅（免稅）倉庫，根據每日的需求，進行出貨，免稅品裝載出保稅倉庫後要通報海關備查，每日班機落地及免稅商品打烊後，都需要清點剩餘的免稅品，預估整備數量，並通報海關備查數量。

華航先前由謝世謙出面召開記者會，後續也透過新聞稿說明，免稅品銷售的確有SOP作業辦法，無論是選品、定價、折扣等都設有控制點，但專機屬於特殊包機銷售型態，為方便人員訂購，未依「菸害防制法」規定，開放菸品預購，提供特殊代碼，並解除上限，也由於菸品數量太多，採取機邊交貨方式。

因此，這9800條的菸品並非循正常的華航保稅品進出貨程序進行。林佳瑋指出，提供維安人員預購，利用總統通關禮遇來掩護，高層不可能不知情。

北檢赴總統府侍衛室調閱資料　華航再次被搜索

至於是否還有其他涉案人士。檢調12日再次兵分多路發動搜索，「國安組」前往總統府侍衛室調閱資料，並提訊吳宗憲。「華航組」則再次搜索空品處等7辦公處，2度約談黃川禎到案說明，其餘也約談4名華航基層。

對於總統專機出訪的程序與作業等相關問題，上報連日詢問華航，華航則表示，目前進入司法調查程序，不予回應專機的相關問題。