因近年來中國對台的滲透力道不斷加強，蔡英文總統在7月間指示由法務部調查局草擬「保防工作專法」須迅速完成立法，來維護國家安全的需求，據指出，未來保防工作專法的統籌機關，將由現行的國安局改由法務部調查局負責，也就是國安局只負責對外的情報蒐集與情報研析，而有關反情報保防捉共諜與間諜的工作，就完全由調查局負責，這就如同現行美國中央情報局（CIA）是負責海外的情報業務，而國內的間諜活動都是由聯邦調查局（FBI）負責偵辦，以權責分明設計，更加明確地保護人權且提升情報效率。

缺乏統整資源平台

不過，國安人士提醒，情報與反情報原本是一體兩面，如何運用各種管道來搜集情報，反過來就是防範進行保防工作所注意的要點，在加上目前中國對台的滲透與吸收管道是靈活多元，接觸地點重心從島內延伸到世界各國，愈來愈多的案件是透過各國情報系統的協助，才能順利的監控，若僅由調查局統籌指揮，是否會窒礙難行值得考慮。

這次蔡總統指示儘速完成「保防工作專法」的制定，主要是現行保防工作依據仍只是民國80 年8 月行政院所核定之「保防工作作業要點」及相應的《全國保防工作會報設置要點》、《推行國民保防教育實施要點》等，全國保防工作區分為「機關保防」、「軍中保防」、「社會保防」三大體系，分別由法務部調查局、國防部政戰局保防安全處、內政部警政署、移民署各自督導所屬機關辦理，各保防體系僅依賴「全國保防工作會報」等會報機制作為聯繫平台，缺乏高層級且強有力的主管機關統合督導，資源未能完全整合。對民間的企業及其他組織機關則因缺乏法源依據，以致民間企業、機關內部無法設置安全保防部門，使得保防工作相形弱化，甚或不再設防。

調查局保防處長王北齊月前在立法院公聽會上指出，目前國內在情報與反情報（保防）體系未明確分立，世界民主國家的情報與反情報體系多分工明確，情報機關僅負責對外之情報蒐集工作，並不具備司法警察權，而反情報機關，因兼負內部防制滲透、機密保護等反制境外敵對勢力入侵的重任，因此必須具備司法警察權，才能從反情報情資及線索中主動發掘並偵辦危害國家安全之間諜案。

據指出，政府高層同意情報與反情報體系多分工明確，現行國安局的「在保防上一把抓」且有權無責的疑慮，才交由調查局統籌指揮；但為了防範執行上侵犯人權，設置監督單位則在研擬中。

另外，中國對台滲透的重點目標，仍是國防軍事及國安情報等政府機敏單位，以及高科技等民間機構，因為中國滲透這些國內民間高科技機構，在該公司參與國防工業或計劃中，探知國防軍事上的機密資料，未來「保防工作專法」將對此來強化民間的保防安全法源依據，正如美國國家情報首長克萊柏（James R. Clapper）在在2016年2月國會聽證會中指出，中國對外滲透領域，也涵蓋私人公司與研究機構，凡涉及國防、能源、金融等之有關國家安全資訊與專利資訊；保防工作不再僅限於政府機構。

但國安人士指出，雖然反制中國對台滲透制定「保防工作專法」是有其必要性，但中國對台工作的預算是「不封頂」的作法，對台吸接觸對象，多選擇在海外國家，而這些國家多與我方無邦交，所以保防工作專法對於境外反制作為，是要增加人力經費在海外布點？還是透過原有的情報系統協助，都是未來會遭遇到的問題。

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