有關中科院在《國家機密保護法》修法通過後，從移民署出入境電腦資料庫中下線，造成無法有效管制中科院涉密員工達5個月之久的漏洞，立委趙天麟表示，從5月到9月之間的5個月內， 中科院涉密境管人數竟從5697人變0人；在這5個月間中科院統計資料共有413人次出境。但移民署事後追查，這5個月空窗期間，有302位涉密人員出境。這302位中離境第一站是前往香港有15人，柬埔寨有3人，但中科院掌握柬埔寨只有2人次，根本就是管制不實，若從第三地前往中港澳地區，更更無法掌握。

趙天麟嚴厲抨擊中科院此舉已使國境不設防，中科院不顧國安，只顧自己；並以內控機制取代國境管制，因此他並質疑中科院的精準核密還是放水推託？讓中科院的核密人數，從5697人變1275人，讓原受管制78%的脫離境管。他要求應權責相符，中科院應比照國防部全員管制出境。

本報6日獨家報導中科院人員出國管制出現5個月大漏洞，引起立委們的關注，立法院外交及國防委員會進行「國防部109年度施政計劃及主管預算案報告」時，民進黨立委趙天麟質詢時指出，中科院自從改為行政法人後，在2019年5月到9月期間，中科院涉密境管人數竟從 5697位變0；事後移署追查發現在此空窗期間共有302位涉密人員出境。而中科院統計資料顯示有413次出境。期中移民署掌握有3個出境前往柬埔寨 但中科院資料卻只有2人次；另外移民署掌握有15人去到香港，但中科院對此無掌握，真得是太離譜。

趙天麟指出，經過對照移民署與中科院出國人數資料比對，移民署未掌握者中科院出國的包括：摩納哥1人次、摩洛洛哥1人次、瑞典1人次、列列支敦士登2人次、阿爾巴尼亞1次、 阿聯聯3人次、斯洛洛伐克1人次、丹麥2人次、黑山2人次、冰島3人次、波士尼亞5人次、匈牙利利3人次、 葡萄牙4人次、斯洛洛維尼亞4人次、梵蒂岡3人次、挪威3人次、克羅埃西亞6人次、波蘭4人次、比利時7人次、捷克6人次、瑞士8人次、西班牙5人次、公海海1人次、盧森堡1人次、西班牙2人次、印度3 人次、希臘1人次、關島1人次。

趙天麟指出，「精準核密」是基於國秘法第五條避免「浮濫核密」而導致人民知情權受損所需， 是對「事物」而非對「人」，以該標準作為出境管制根本張冠李戴，錯誤引用。但中科院則解釋說是為了避免侵害同仁「遷徙自由」、「工作權」， 才會下架管制資料。但趙天麟則抨擊說，「國家安全」與「出去玩的自由」孰輕孰重？而且只要是國防部人員，不分文職、軍職、雇用，更不問涉密與否，出國皆需管制。國防部若認同中科院「精準核密」藉口，是否代表未來國防部也將放寬自身出境管制？

對於國防部嚴德發表示，對於相關缺失目前已在檢討中，也會對中科院加強管控。因此目前中科院核密的共有2317人，但現在還有33個專案，因此洩密人員還在滾動執行。