國安局為配合軍公教退休人員改為每月領取退休金新制，要求退休文職人員改到合作金庫帳戶領退休金一事，據指出，合作金庫配合政府金改政策在2006年5月1日與中國農民銀行合併，農銀的業務完全轉移到合庫內，農銀長期接辦國防部、情報單位的業務，合作關係良好備受信任，因此隨著合併，合作金庫成為軍方與情報單位往來最密切的銀行。

知情人士指出，在國安密帳事件的鞏案代墊款中，1999年2月4日當時外交部長胡志強歸還代墊款，將1,070萬元美金匯入國安局盛昌公司在中國農民銀行國外部的帳戶，讓中國農民銀行在國安密帳中，無論是代號「奉天」、「當陽」專案一直是經費主要往來的銀行，雖然國安密帳曝光，但該銀行內部部分承辦國防部與情報單位業務的人員，都是從軍方主計單位退伍轉任，在保密與安全性高極高，隨著合併到合庫，其業務也跟著到新銀行，讓合作金庫持續承接軍方與情報單位的業務。

該名人士指出，中國農民銀行在大陸時期，曾是當時中華民國法幣四大發行銀行之一，1949年隨中華民國政府移往台灣，進駐臺北市。1967年5月20日，中國農民銀行正式在臺復業，除繼續辦理農業金融業務外，也辦理一般商業銀行業務。在政府指示下，早年國防部對外採購的款項都是通過中國農民銀行來辦理，以及軍人各項金融業務，隨著這項合作關係，目前國軍營區內可以設置服務窗口的就僅有郵局和中國農民銀行，連國軍眷村改建基金也都是存放在中國農民銀行，其相關業務都是由該銀行來承辦，因此隨著合併到合作金庫，目前國軍各營區內原中國農民銀行就改成合作金庫的服務窗口。

據指出，在戒嚴時期的政府指示，不單單是國防部，包括國安局、軍情局以及警備總部的情報經費通通都是交由中國農民銀行來處理，為求安全性與配合情報業務的執行，中國農民銀行的董事長或是總經理都是由國防部主計局局長退伍後轉任，而內部負責軍方與情報單位業務的主管，也大部分是軍方主計單位轉任過來的，因此，早年中國農民銀行幾乎就是國防部主計單位的退輔會。

知情人士指出，也就是這層的關係，隨著中國農民銀行合併到合作金庫，而承辦國防部與情報單位業務也是由原負責業務的副總經理來執行，因此，至今情報單位還是以合作金庫作為情報業務的往來銀行，因此國防部與情報單位至今還是維持只與台銀、郵局與合作金庫三家銀行打交道。

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