針對武漢肺炎疫情升溫，為確保口罩國內所需供應正常，行政院宣布即日起禁止口罩出口一個月，資深媒體人黃智賢痛批，台灣10天前才為了澳洲野火捐了10萬個口罩，10天後卻禁止口罩出口是「泯滅良心」的政權。不過，蘇貞昌25日參拜板橋接雲寺時表示，「自救才能救人」，並批評中國政府隱匿疫情，還在世界衛生組織排擠台灣，防疫沒國界，中國是不理性、蠻橫行為。

蘇貞昌指出，停止口罩出口一個月，是因應看到中國武漢肺炎升溫，台灣要準備充足，中國隱匿疫情才讓疫情變嚴重，這時候，中國仍在WHO世界衛生組織排擠台灣，說要先承認「一中」，才准台灣參加，讓台灣知識、資訊跟經驗不能在WHO世界衛生組織，和世界各國分享、一起防疫，蘇貞昌認為，這實在遺憾也不對，防疫沒有國界，如此讓人反而看到中國不理性與蠻橫行為。

另外，前總統馬英九批評總統蔡英文，未能以身作戴口罩防疫，蘇貞昌則是回應，防疫是視疫情狀況，像過去SARS是空氣傳染，現在武漢肺炎是近距離飛沫傳染，提醒有症狀務必戴口罩，也希望全國民眾不必恐慌，做好衛生自主管理就可。

對於台灣防疫工作，蘇貞昌也說，政府都持續嚴密掌控，新發現兩起確診病例其實都有武漢旅遊史，並非台灣內部社區感染，目前已嚴密隔離。

如今，一方面也下令國內口罩暫停出口，蘇貞昌也呼籲國人本身有症狀要立刻看醫生戴口罩，且使用醫療用的就可以，不用到N95，口罩都也都足夠請民眾放心，醫院相關隔離病床都充足，政府準備也相當充分，請國人作好衛生自主管理。