3月20日指揮中心公布中研院有確診病例，和中研院密切往來的台灣大學28日在臉書發表聲明，強烈要求中研院交出確診者的足跡資訊，以便採取防疫應變措施，卻被告知衛福部疾管署不允許中研院揭露這些重要資訊。

台大在臉書發表「台大防疫措施說明」，指出台大和中研院往來密切，過去2周與中研院有接觸之教職員工生人數即高達732名。台大也在得知中研院有確診案例後，迅速要求2周內去過中研院的教職員工生不要到校上班上課，與中央流行疫情指揮中心要求所有從國外入境者皆須進行居家檢疫的作法相同。

台大表示，在疫情緊張時刻採取料敵從寬，禦敵從嚴的積極管制措施，為的就是保障校園安全與師生員工的健康。若中研院不交出確診者足跡資訊，台大將無法直接防堵疫情缺口，依教育部規定「2人確診即須關校」，若有同學被感染而不自知而造成群聚感染，恐讓台大被強制關校。台大校方也說，「少部分人士因不理解本校措施的積極性與重要性而率爾批評，本校深表不以為然。」

對此，中研院回應，先前已公布過4位確診個案均為同所、同樓層、同實驗室，活動範圍以物理所為主，病況穩定康復中。

此外，中研院內部同仁也擔心確診案例是否到過中研院體育館？中研院23日已發出公告，經向防疫團隊查證，有一位確診員工在12日下午會議之後，有在晚上6點30分左右進入體育館，約晚上8點25分離開，但無法確定使用那些設施。

中研院表示，曾問過疾管署，可否提供確診員工於3月12日後的行動軌跡，疾管署回應依規定無法提供。而3月26日中央流行疫情指揮中心已向媒體證實，中研院的接觸者採檢結果全部是陰性。

雖然台大校方對中研院一事決策果斷快速，但該臉書貼文下的留言有不少台大學生吐槽，「禁止學生活動當機立斷，對校外人士進出卻一拖再拖。怎就不擔心校外入內的人可能有去過中研院？」「不禁止上百人的教學活動，卻禁止十幾人的社團。」認為校方對台大不顧學生受教權和人身自由，全以「行政命令為優先」表示不以為然，更批評台大對校外人士從寬，卻對學生活動從嚴處置。

由於台大校外人士人流眾多，在校學生相當擔心未經嚴格檢疫而進入台大校園的遊客造成防疫破口。（莊人祥：趴趴走最高罰百萬）