WHO秘書處於4月20日記者會表示，疫情資訊最早來自中國武漢，而台灣最早通報電子郵件中並未通報有人傳人現象。對此，外交部認為，哪一個國家率先通報WHO，不應是各方關切焦點，應是秘書處當時的處理、研判與回應。

外交部並強調，希望WHO秘書處能進一步說明，各國在2019年底，疫情初始期有哪些通報，並進行何種處置，以釋各界的疑慮。

外交部強調，台灣衛生福利部疾病管制署已善盡在國際防疫合作方面的責任。在獲知中國武漢市可能爆發「人傳人」疫情後，就於2019年12月31日透過電子郵件通報WHO的「國際衛生條例」（IHR）聯繫窗口，吿以中國武漢市發生至少7例非典型肺炎（atypical pneumonia），並特別提及相關病例已在「隔離治療」，希望取得更多疫情資訊。

外交部指出，台灣也曾說明，由於當時國內並無確診病例，公衛專業人員僅能由武漢市狀況研判疾病有「人傳人」的可能，無法明示該病有「人傳人」的情形。

外交部表示，新冠肺炎（武漢肺炎）疫情最初在中國武漢市爆發時，其他各國對於疫情狀況均一無所悉，WHO作為國際間最重要的醫衛專業組織，應就疫情提供各國即時且正確的資訊及指引。台灣當時向WHO秘書處所作的通報，正是善盡維護國際公衛的責任。

外交部再度呼籲，WHO秘書處回歸該組織成立的初心，以專業、中立立場協助各國有效應對這場全人類共同面對的武漢肺炎危機。（磐石艦共27人確診）