立法院22日舉行國防委員會針對磐石軍艦進行相關備詢，並安排磐石軍艦的艦長、支隊長及醫官進行視訊報告，但此舉引來藍、綠雙方不滿。綠委認為，不應找醫官、各小官麻煩，加上公開其面相身分會被獵巫等問題；藍委則認為，當事人本身是官員本應要備詢，此次透過視訊是因隔離所致。

立法院22日舉行，第10屆第1會期外交及國防委員會第15次會議，會前主席呂玉玲報告，因磐石軍艦的艦長、支隊長及醫官在進行隔離，所以將透過視訊備詢；指揮中心認為可行，但視訊時間不宜過長，因此將在艦長等人透過視訊發言後，委員再提問。而此新增程序，引來民進黨立委在主席台前抗議程序問題，藍、綠雙方未達共識，委員們進行程序發言，導致國防部長嚴德發上台報告磐石軍艦染疫推延。

民進黨立委趙天麟表示，每位委員針對詢問都會事先登記，但此次在法定程序中插出新的程序，是否需要再重新登記發言，是一大問題。民進黨立委羅致政則認為，視訊會議查無正當性，反對立法院公審醫官，對醫官不公平，更反對全民公審，若透過視訊將無法保護其身分，恐會被獵巫，依《傳染病防治法》11條，要保護其隱私，「擔心一旦公審，他的身分、家人會被全民肉搜，如何保護？」

國民黨立委蔣萬安則表示，事前要透過視訊會議備詢已經過指揮中心同意，而此次也是給艦長、醫官向外界澄清、說明的機會，而程序問題，可以把問題集中，透過主席一同提問，讓艦長快速回答。國民黨立委林為洲強調，要透過視訊會議的當事人本身是官員，官員本應到場接受備詢，但因隔離才改視訊備詢，只是實體改為視訊。

對此，中央流行疫情指揮中心疫情監測組長周志浩表示，要回歸《傳染病防治法》第11條規定，除非獲得他人意願，但還是不應對當事人錄音、錄影、攝影，全是基於法定規定；此外，在社會壓力情形下，對當事人身心是否有影響，也是備受關心的。

召委呂玉玲強調，事前有和國防部做溝通，才架設視訊設備，現在才又說要依當事人是否同意。

列席的海軍參謀長敖以智表示，已在22日稍早、上午9時57分聯絡支隊長，但支隊長沒有明顯表達是否要接電話或接受視訊；21日照正常規定聯絡詢問，支隊長表示沒有意願接受視訊。而21日聯絡的結果，其他人都不願意接受電話或視訊詢問。

呂玉玲表示，相信國軍都是非常服從長官的命令，今天很遺憾，給他們機會說明真相，保障權益，但是他們錯失機會，未來國防部如何定調，他們自求多福。隨後，即由嚴德發上台進行磐石軍艦染疫案專案報告。（磐石軍艦染疫案完整報告）