台灣即便防疫有成，但仍被WHA拒之門外，中國國台辦甚至在20日發文，怒嗆指揮官陳時中是「隱瞞疫情的一把好手」。對此，陳時中則21日回應，「歷史自有公斷」不要讓對立軟化與病毒對抗的力量。

WHA在18日式訊大會，播放中國國家主席習近平的影片，肯定世界衛生組織WHO在祕書長譚德塞的率領下有很大的貢獻。事後陳時中在記者會遭問及此事曾回應，中國和世衛現備受外界檢視，許多國家提案要求徹查，「他們雙方互相支持一下也是應該的。」

不料，這說法引起國台辦不滿，20日晚間將矛頭指向陳時中，他們透過官方微博發文表示，陳時中「最近有點飄」，因為被民進黨自導自演的「台灣防疫世界第一」大戲捧成了「男一號」。

國台辦甚至批評陳時中，「防疫未見專業，抹黑大陸、攻擊世衛、刁難台胞、隱瞞疫情卻是一把好手。以政治操作能力而論，陳時中確是民進黨當局最需要的人才。」

被對岸砲火擊打，陳時中在21日上午堵訪時反擊，他說，台灣都是很透明的，「這不是我要隱匿就能夠去隱匿的。」

陳時中21日下午再度在例行記者會回應此事，他表示，在疫情開始之初，透明的資訊、誠實謙卑對抗病毒是既定的戰略，從抗議第一天到現在都沒有變。

他說，決策有時會有兩難或痛苦的時候，都是在有限時間下做出不得不做的決定；「面對批評，有錯則改；對錯，時間拉長，歷史會有公斷。」

陳時中表示，人與國家都會恐懼，任何錯誤及時修正，人不可能沒有錯，人面對未知病毒必須謙卑，不可能不犯錯，但要把犯錯減到最低。（【疫情影響】免洗餐具使用增五成）