新冠病毒研究即時追蹤病毒變異,D614G突變成為一大擔憂。(湯森路透)
新冠病毒的研究又有更近一步的發展,目前研究學者開發了一個分析管道,來監測追蹤新冠病毒的突變。主要研究的是病毒的棘突蛋白(spike protein),因為它是感染人體細胞的媒介,同時也是大多數疫苗和抗體治療的研究目標。
截至目前為止,已確定棘突蛋白累積14種突變,其中D614G突變是最急需關切的問題。D614G突變於2月初開始在歐洲傳播,當傳入新地區時,此突變病毒即成為疾病流行的主要形式,並與當地傳播的病毒株進行重組,造成更多種的病毒株感染。
這些研究成果對於新冠肺炎的傳播、病因與免疫干預有極大的幫助。
主要有三個原因使得新冠病毒的危險性極高。首先,人類並沒有這種病毒的免疫經驗,因此感染機率極高。此外,此病毒具有高度傳播性,並且死亡率很高。
雖然研究觀察新冠病毒的多樣性較低,但因迅速的全球傳播,成為少見的自然環境,對病毒突變極為有利。如同流感在流行的期間,也會因為環境中的變因讓病毒產生變異。
流感的流行是季節性的,但目前仍不知道新冠病毒是否會隨著天氣的溫度、濕度升高,而隨之減弱。不過,病毒本身的高傳播性以及人類先天缺乏的免疫抗體,可能會讓病毒持續流行。
洛斯阿拉莫斯國家實驗室(Los Alamos National Laboratory)的HIV數據庫小組已轉向即時分析追蹤新冠病毒棘突蛋白的變異。利用全球共享流感數據倡議組織(Global Initiative for Sharing All Influenza Data, GISAID)數據庫作為基線,進一步即時記錄病毒的變異。
Genome sequences of first #COVID19 cases from Beijing's Xinfadi Wholesale Market released by China CDC via GISAID. Similar to viruses from Clade GR pic.twitter.com/Ec3e7TmncP
— GISAID Initiative (@GISAID) June 18, 2020
病毒的棘突蛋白是病毒感染和疫苗藥物主要的研究目標,因此研究學者需要管道來評估預測棘突蛋白的演變。目前已經建立了三階段的數據分析,主要以識別動態變化的突變,以及研究病毒重組對於傳播的影響為主。
其中發現編號為D614G的病毒變異,可能起源於中國或歐洲,但首先開始在歐洲快速傳播,並迅速擴散,現在已經成為許多國家主要的流行病毒形式。
如同前文所提,D614G突變已成為目前主要病毒傳播流行的形式。
根據即時追蹤數據顯示,D614G突變最早是在德國發現,並隨著疫情爆發,擴散至全球。
D614G本身的結構以及免疫學原理,可能會增加可傳播性。目前科學界擔心的是,如果此病毒變異能夠增加傳播性,那麼它也可能影響疾病的嚴重程度。
目前GISAID中並沒有可用的臨床數據結果,因此還需進行進一步的研究追蹤,掌握病毒變異和加快疫苗開發。