受新冠肺炎影響，2020年的公費流感疫苗施打情形盛況空前，醫療院所門口大排長龍，短短開打4天，全台就已施打超過162萬劑疫苗，是去年的1.5倍之多，因應「打氣」踴躍，部分醫院疫苗仍然缺貨，疾管署將於12日再調度60萬劑，補足各大醫院需求。

2020年的公費疫苗5日才開打，接種量就大爆增，衛福部9日下午公布前4天的施打數據，目前已累積接種162.2萬劑，第一天（5日）42萬、第二天（6日）最多，為45.2萬、第三天（7日）39.1萬、第四天（8日）35.9萬劑，已是2019年同期107萬劑的1.5倍之多。

因疫情影響，疫苗今年施打情形十分踴躍，醫院前也出現大排長龍的情況，堪比開放購買實名制口罩的情形；花蓮市衛生所每日250個名額半小時內秒殺，高雄市3天內就接種超過16萬劑，是往年2倍，屏東縣幾個大醫院的疫苗庫存也相繼施打完畢。民眾接種意願高於預期，讓不少醫生直呼是「史無前例」，連前副總統陳建仁出席活動時都說「我也登記不到。」

今年接種公費流感疫苗的盛況前所未見，疾管署日前也緊急進行調度，但仍有部分醫院傳出疫苗大缺貨的情況。疾管署副署長莊人祥指出，因應民眾踴躍接種疫苗，12日將會再調度一批、約60萬劑的疫苗，補足各大醫院需求。

莊人祥指出，根據往年經驗，公費疫苗開打第1周人數確實會比較多，第2周開始趨勢才會較為明顯，也才能分辨出究竟接種疫苗的是本來就很有意願施打的民眾，還是以往比較不打疫苗的民眾。

疾管署也再度提醒，9大類公費流感疫苗對象包含6個月以上嬰幼兒、國小至高中職（五專）學生、慢性病者、50歲以上成人、65歲以上老人、育有6個月內嬰兒的家長、醫護人員等，共有1621萬人。（全教總嗆康軒惡劣行為「反教育」）